HDF5/CGNS-从源代码编译HDF5和CGNS

　　CFD General Notation System (CGNS)是CFD软件中非常重要的数据格式，正在得到越来越广泛的应用，CGNS 提供了一个通用的可移植且可扩展的标准，用于存储和检索计算流体动力学 (CFD)的分析数据。 它由一个自由和开放软件。 它是自我描述的、独立于机器的、有据可查的，也是美国研究所航空航天 (AIAA)推荐标准。

　　HDF5 (Hierarchical Data Format) 由美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校 UIUC (University of Illinois at Urbana-Champaign) 开发，是一种常见的跨平台数据储存文件，可以存储不同类型的图像和数码数据，并且可以在不同类型的机器上传输，同时还有统一处理这种文件格式的函数库。

　　HDF5

　　The HDF5® Library & File Format - The HDF Group

　　HDF5在官网和github上提供了源代码和编译好的二进制文件，二进制文件可以直接使用。

 

 

　　Linux下的HDF5编译较为简单，只需要以下步骤：

mkdir build
cd build
cmake ..
make -j
make install

　　在“cmake ..”命令中需要注意指定HDF5的安装目录，默认是安装到系统位置，也可以自己指定位置，但是要记下自己指定的位置，稍后CGNS需要。

　　HDF5没有必需的依赖库，如果需要的话可以自行安装SZIP、ZLIB等库。

　　通常，以上命令执行完成后，HDF5就已经安装到了预定位置。如果没有cmake，也可以使用configure。

　　CGNS

　　CFD通用符号系统 (cgns.github.io)

　　由于CGNS依赖HDF5，因此在编译CGNS时需要先编译HDF5，并在编译CGNS时制定HDF5的路径。在确保HDF5正确安装完成后，再编译CGNS。

　　Windows下使用CMake+Visual Studio编译CGNS，链接静态库时，需要一并链接lib中的libaec.lib、libszaec.lib、zlib-static.lib。

　　链接时提示HDF5库缺少 __imp_StrStrIA （H5system.obj）的问题，需要在附加依赖项中添加“shlwapi.lib”。

　　Linux步骤：

mkdir build
cd build
cmake .. -DCMAKE_PREFIX_PATH=/path/to/hdf5
make -j
make install

　　在"cmake .."命令中需要注意指定CGNS的安装目录，默认是安装到系统位置，也可以自己指定位置。“-DCMAKE_PREFIX_PATH”是为了指定刚刚HDF5的安装路径，路径正确的话会有如下输出：

-- HDF5 find comps: C;shared
-- HDF5 C libs:1 static: and shared:1
-- HDF5-1.14.3 found: INC=/path/to/hdf5/include TOOLS=/path/to/hdf5/bin HDF5_BUILD_SHARED_LIBS=YES
-- HDF5 link libs: hdf5-shared

　　否则就会提示：

　　Could NOT find HDF5 (missing: HDF5_DIR)

　　通常，以上命令执行完成后，CGNS也已经安装到了预定位置。如果没有cmake，也可以使用configure。