MageCK 分析sgRNA 筛选

#软件安装

1. 参考链接https://sourceforge.net/p/mageck/wiki/Home/  

本身打算按照conda install +package的方法，安装，但是一直出现：

# Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.

2.采用原代码文件安装。

下载源代码：https://sourceforge.net/projects/mageck/

 

需要下载到mageck-0.5.9.4.tar.gz文件。

# tar -zxvf mageck-0.5.9.6

进入文件夹找到setup.py #说明这是一个python写的安装包。

#python3 setup.py install.

即可

 

#操作实例

参考文章： https://hpc.nih.gov/apps/MAGeCK.html  

MAGECK2官方说明链接：https://sourceforge.net/p/mageck/wiki/Home/