摘要: 没事的时候,翻github,发现了qiime view网站的源代码是公开的,可以静态布署。手上有个云服务器,前几天又获得了一个免费域名qiime2.cn,于是做了一个镜像网站view.qiime2.cn,分享给需要的人。服务器在重庆,国内延时很小,打开完全速度稍慢,应该是服务器性能的原因,如果需要用 阅读全文
posted @ 2020-03-26 14:45 200572 阅读(447) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 题目来源于生信技能树论坛,参考了几个帖子。 http://www.biotrainee.com/thread-1695-1-1.html http://www.biotrainee.com/thread-1316-1-1.html 比如这个最简单的,表格爬取: http://www.letpub.c 阅读全文
posted @ 2017-10-09 15:58 200572 阅读(190) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: http://www.zd200572.com/2017/09/25/sequencer_comparation/ 阅读全文
posted @ 2017-09-27 14:10 200572 阅读(413) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: bioconda是conda上一个分发生物信息软件的频道,现在已经有超过2700款软件。由于国内没有基镜像,下载安装生物信息软件速度十分缓慢,经常中断,生物信息人迫切需要一个国内镜像。Bioconda is a channel for the conda package manager specia 阅读全文
posted @ 2017-09-21 13:08 200572 阅读(1532) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 我的书单 阅读全文
posted @ 2017-08-28 12:36 200572 阅读(179) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 中国健康、医疗大数据中心盘点(持续更新) 1、三个国家队 中国健康医疗大数据股份有限公司、中国健康医疗大数据产业发展集团公司和中国健康医疗大数据科技发展集团公司 4月份,中国健康医疗大数据产业发展集团公司由中国电子信息产业集团公司、国家开发投资公司、中国联合网络通信有限公司、中国国有企业结构调整基金 阅读全文
posted @ 2017-08-24 11:58 200572 阅读(1145) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 首先是软件源文件,感谢有人分享:https://pan.baidu.com/s/1gdprJij 主要参考了这个,(重要的事情说三遍:先看这个先看这个,先看这个!https://wenku.baidu.com/view/603f1de9d1f34693dbef3e11.html这个ppt是罗氏中国的 阅读全文
posted @ 2017-08-22 13:29 200572 阅读(8130) 评论(1) 推荐(2) 编辑
摘要: 在技能树论坛里看到有人说ascp可以下载宽带满速,就百度了一下,但是发现ncbi的正常可用,ebi的已经不能用了,所以更新一下。 ebi 千人基因组计划数据下载代码 ascp -i asperaweb_id_dsa.openssh -Tr -Q -l 6M -P33001 -L- -k1 era-f 阅读全文
posted @ 2017-08-18 15:40 200572 阅读(1331) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 我在中国科大开源镜像站的github上提交了bioconda新镜像申请,现在处于投票阶段,大家快去投票。地址在这:https://github.com/ustclug/mirrorrequest/issues/125 请在 Github Issue 页面使用 Emoji 表情来投票。 请参考这里的使 阅读全文
posted @ 2017-08-02 16:06 200572 阅读(607) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: shell还没入门,确切的说是还没学,用python3写了个小脚本统计23andme、gsa、wegene各染色体位点.代码如下:23andme: gsa的同上,稍做一两处调整。wegene的没有源数据,找的生信菜鸟团jimmy的shell # 结果分析 从图中可以看出,毕竟23andme是最早做的 阅读全文
posted @ 2017-07-20 14:13 200572 阅读(367) 评论(0) 推荐(0) 编辑