随笔分类 - 生物信息学流程
倾向于个人单独练习
摘要:1、概述 Smart-seq2是一种单细胞RNA测序技术,用于分析单个细胞的基因表达情况,并可以对单个细胞的基因表达进行分析。 2、基本原理 Smart-seq2利用了莫罗尼小鼠白血病病毒逆转录酶(MMLV-RT)的两个特性: 该逆转录酶在合成到cDNA的3’端时会随机引入几个不依赖于模板的碱基,多
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摘要:1、OrthoFinder 教程:用于比较基因组学的系统发育直系学推断 1.1 orthofinder介绍 OrthoFinder是一种快速、准确和全面的比较基因组学分析工具。它可以找到直系和正群,为所有的正群推断基因树,并为所分析的物种推断一个有根的物种树。OrthoFinder还为比较基因组分析
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摘要:目的: 对illumina数据进行处理,利用 RNA-Seq 发现新的 RNA 变体和剪接位点,或量化 mRNA 以进行基因表达分析等。对两组或多组样本的转录组数据,通过差异表达分析和对所发现的差异表达基因集合进行功能富集分析以推断生物学功能。 数据准备: 数据下载: Human genome(GR
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