LIDC-IDRI肺结节项目 -- 预处理数据集

实战参考代码：代码

一、路径、参数配置（lung.conf）

• lidc_dicom_path: LIDC_IDRI数据集原始位置 

• image_path，mask_path：保存处理后的含有结节的肺部图像和掩码图像路径

• clean_path_image，clean_path_mask：保存处理后的不含有结节的肺部图像和掩码图像路径

• meta_path：保存结节元数据路径

 二、处理数据集（prepare_dataset.py）

　　主要记录遇上的问题。

　　问题一：

　　Could not establish path to dicom files. Have you specified the `path` option in the configuration file C:\Users\86152\pylidc.conf?

　　解决方法：在路径C:\Users\86152里找到pylidc.conf文件，使用记事本打开后添加LIDC_IDRI数据集原始位置 。

 

　　问题二：

　　解决方法：找到smoothing.py文件（点击链接自动跳转），看到第155行和第164行，改成下面图片的形式。

　　smoothing.py原文件：

　　更改后： 

　　问题三：

　　解决方法：找到prepare_dataset.py文件（点击链接自动跳转），看到第152行和第153行，改成下面图片的形式。

　　prepare_dataset.py原文件：

 　　更改后：

 

　　问题四：

　　代码运行完后发现处理结果并没有写入Meta文件夹里的meta_info.csv文件里，问题暂未解决。

 

 

参考：(41条消息) 【深度学习】肺结节分割项目实战一：处理数据集_肺部分割数据集_小河梦的博客-CSDN博客