LIDC-IDRI肺结节项目 -- 预处理数据集

实战参考代码:代码

一、路径、参数配置(lung.conf)

  • lidc_dicom_path: LIDC_IDRI数据集原始位置 
  • image_pathmask_path:保存处理后的含有结节的肺部图像和掩码图像路径
  • clean_path_image,clean_path_mask:保存处理后的不含有结节的肺部图像和掩码图像路径
  • meta_path:保存结节元数据路径

 二、处理数据集(prepare_dataset.py)

  主要记录遇上的问题。

  问题一:

  Could not establish path to dicom files. Have you specified the `path` option in the configuration file C:\Users\86152\pylidc.conf?

  解决方法:在路径C:\Users\86152里找到pylidc.conf文件,使用记事本打开后添加LIDC_IDRI数据集原始位置 。

 

  问题二:

  解决方法:找到smoothing.py文件(点击链接自动跳转),看到第155行和第164行,改成下面图片的形式。

  smoothing.py原文件:

  更改后: 

  问题三:

  解决方法:找到prepare_dataset.py文件(点击链接自动跳转),看到第152行和第153行,改成下面图片的形式。

  prepare_dataset.py原文件:

   更改后:

 

  问题四:

  代码运行完后发现处理结果并没有写入Meta文件夹里的meta_info.csv文件里,问题暂未解决。

 

 

参考(41条消息) 【深度学习】肺结节分割项目实战一:处理数据集_肺部分割数据集_小河梦的博客-CSDN博客

 

posted @ 2023-03-31 18:50  盏茶  阅读(1736)  评论(0)    收藏  举报