R语言统计 - 随笔分类(第2页) - ywliao

posted @ 2017-04-17 19:04 ywliao 阅读(107203) 评论(1) 推荐(4)

摘要：很多时候，我们需要对取出的SNV进行注释，这个时候可能会在R上进行注释，通常注释文件都含有Chr(染色体)、Start(开始位点)、End(结束位点)、Description（描述），而我们的SNV文件通常是拥有Position（位置），因此我们可以先定位Chr，再用Postion去定位到Start 阅读全文

posted @ 2017-04-07 20:50 ywliao 阅读(2853) 评论(0) 推荐(0)

R语言实现二分查找法

摘要：二分查找时间复杂度O(h)=O(log2n)，具备非常高的效率，用R处理数据时有时候需要用到二分查找法以便快速定位阅读全文

posted @ 2017-04-07 20:02 ywliao 阅读(1492) 评论(1) 推荐(0)

R语言基因组数据分析可能会用到的data.table函数整理

posted @ 2017-03-24 21:56 ywliao 阅读(9586) 评论(0) 推荐(1)

R语言数据分析利器data.table包 —— 数据框结构处理精讲

posted @ 2017-03-20 19:32 ywliao 阅读(34461) 评论(0) 推荐(0)

寻找与疾病相关的SNP位点——R语言从SNPedia批量提取搜索数据

摘要： SNP是单核苷酸多态性，人的基因是相似的，有些位点上存在差异，这种某个位点的核苷酸差异就做单核苷酸多态性，它影响着生物的性状，影响着对某些疾病的易感性。SNPedia是一个SNP调査百科，它引用各种已经发布的文章，或者数据库信息对SNP位点进行描述，共享着人类基因组变异的信阅读全文

posted @ 2017-03-08 18:30 ywliao 阅读(6416) 评论(8) 推荐(1)

R语言从小木虫网页批量提取考研调剂信息

摘要：一、从URL读取并返回html树 1.1 Rcurl包使用Rcurl包可以方便的向服务器发出请求，捕获URI，get 和 post 表单。比R socktet连接要提供更高水平的交互，并且支持 FTP/FTPS/TFTP，SSL/HTTPS,telnet 和cookies等。本文用到的函数是bas 阅读全文

posted @ 2017-02-22 21:40 ywliao 阅读(2273) 评论(3) 推荐(0)

使用R语言将微信记录制作成词云（简洁）--情人节奥义

摘要：一、导出并读入微信聊天记录参照百度的方法，使用同步助手。安装同步助手--连接手机（安卓苹果均可)--点击“其他功能“--点击微信图标即可进入聊天记录导出界面（非常简单）。导出数据后直接用read.table读入表格命令： dat <- read.table("message.txt",skip 阅读全文

posted @ 2017-02-13 22:04 ywliao 阅读(5119) 评论(4) 推荐(2)

判断数据是否服从某一分布（二）——简单易用fitdistrplus包

摘要：一、对数据的分布进行初步判断 1.1 原理对于不同的分布，有特定的偏度(skewness)和峰度(kurtosis)，正态分布、均匀分布、逻辑斯谛分布、指数分布的偏度和峰度都是特定的值，在偏度-峰度图中是特定的点，而伽马分布和对数正态分布在偏度-峰度图中是一条直线，贝塔分布在偏度-峰度图中是一片区阅读全文

posted @ 2017-02-09 17:00 ywliao 阅读(17193) 评论(1) 推荐(1)

判断数据是否服从某一分布（一）

摘要：一、使用图形对数据初步进行描述。使用（直方图，经验分布图，与QQ图）描述数据的分布结构，预判分布。 1.常用直方图，适用于连续性数据。 hist(x),lines(density(x)) 2.经验分布图，一般的总体分布。 ecdf(x) #生成x的向量 plot(x, ..., ylab="Fn( 阅读全文

posted @ 2017-01-12 18:10 ywliao 阅读(38033) 评论(0) 推荐(1)

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