R语言 - 随笔分类 - 苑黎

摘要：https://cran.r-project.org/bin/windows/base/old/ 阅读全文

posted @ 2017-06-25 21:30 苑黎阅读(305) 评论(0) 推荐(0)

R作图

摘要：R一般的散点图：plot() 折线图：plot() lines() 柱状图 barplot() 箱子图 boxplot() 直方图：hist() 热力图：heatmap 画地图的：拓展包 maps，sp包在一张画板上画多个散点图 par(mfrow=c(2,3)) 绘制的2行3列个图形图例的参数阅读全文

posted @ 2016-10-11 21:03 苑黎阅读(235) 评论(0) 推荐(0)

R常见的几种常见统计图

摘要：1，向日葵散点图 2，热图（颜色越深，数值越大） 3，折线图（散点图），绘制散点图集用 paris(data.frame）阅读全文

posted @ 2016-09-27 18:52 苑黎阅读(1144) 评论(0) 推荐(0)

R随笔（2）

摘要：1,查看R中的变量模式（对象的数据类型）mode() 2,因子（factor）, table()可以获取多个因子的交叉表，可以知道每个因子出现的次数 > g<-c("f","m","m","m","f","f","m","f","m","f") > g<-factor(g) > a<-factor( 阅读全文

posted @ 2016-09-11 11:06 苑黎阅读(168) 评论(0) 推荐(0)

矩阵运算相关函数

摘要：矩阵专门取一列的时候，如果想得到的这一列还是矩阵，则需要设置一个参数：m[,4,drop=F] 阅读全文

posted @ 2016-08-28 22:13 苑黎阅读(1031) 评论(0) 推荐(0)

R中的一些空值

摘要：1， NA: 缺失数据NaN: 无意义的数，比如sqrt(-2)Inf: 正无穷大-Inf: 负无穷大 R语言中还有一种Null对象，一般被用在函数参数中，表示该参数没有被赋予任何值，或者某些函数返回值为Null。 NA值是占取一个数据的位置，NULL值是一个空值。 2，判断一个数值是否是以上值阅读全文

posted @ 2016-05-27 17:33 苑黎阅读(1978) 评论(0) 推荐(0)

R 指定产生一些数据的函数

摘要：产生一些有顺序的数据的函数seq(), rep(),sample() 1，seq(from = 1, to = 1, by = ((to - from)/(length.out - 1)), length.out = NULL, along.with = NULL, ...) > seq(1,20, 阅读全文

posted @ 2016-05-27 16:58 苑黎阅读(243) 评论(0) 推荐(0)

R随笔

摘要：最近处理了一些数据发现了写代码过程中值得注意的地方，特别是写循环的时候 1， trait_data<-numeric() for(i in 0:(indi_num-1)){ trait_eve<-traitdata[(3*i+1):(3*(i+1))] trait_data<-rbind(trai 阅读全文

posted @ 2016-05-12 22:12 苑黎阅读(185) 评论(0) 推荐(0)

R文本处理

摘要：最近写了一些代码，用R处理文本格式。就写一些我最近用的一些处理字符串的函数 value=FALSE表示的是grep()返回的是所匹配字符串的位置 value=TRUE返回是所要找的字符串。perl=TRUE代表可以用适合perl的正则表达式 fixed=TRUE表示pattern is a stri 阅读全文

posted @ 2016-05-10 20:56 苑黎阅读(249) 评论(0) 推荐(0)

用R读取外部的excel文件

摘要：今天找了好多包来快速读取数量量比较大的excel包，但是总是出现OutOfMemoryError (Java): GC overhead limit exceeded，内存溢出报错。找到了两个R包可以解决该问题目前找到三个包可以读取excel数据。 1 ，读取excel文件的包：xlsx包只能读阅读全文

posted @ 2016-04-22 16:07 苑黎阅读(2458) 评论(0) 推荐(0)

R中的ggplot2包

摘要：qplot()函数是一个快速作图函数用数据diamands head(diamonds) carat cut color clarity depth table price0.23 Ideal E SI2 61.5 55 326 0.21 Premium E SI1 59.8 61 326 0.2 阅读全文

posted @ 2016-04-19 22:12 苑黎阅读(1255) 评论(0) 推荐(0)

R中的一些数据形式

摘要：当我们输入的数据形式有字符串和数字的时候，更好的输入形式就是以数据框的形式输入进去，数据框也可以用ncol() ,nrow(),取具体某个值这些函数等但是以数据框形式输入，有字符串时，这些字符串默认是以因子的形式的例如： Next, you just combine the vectors t 阅读全文

posted @ 2016-03-28 15:35 苑黎阅读(263) 评论(0) 推荐(0)

R数据处理

摘要：NA值缺失值：就是在收集数据的时候我们没有收集到，或者因为某种原因为获得的数字，也或者是我们并不想得到这个数据当有 > x = c(1,4,7,NA,12,19,15,21,20)> mean(x) > mean(x,na.rm=TRUE)[1] 12.375 1，R中对数据进行排序的三个函数：阅读全文

posted @ 2016-03-28 15:22 苑黎阅读(202) 评论(0) 推荐(0)

R语言的一些矩阵运算

摘要：矩阵的存储默认是按列进行存储的 1，创建矩阵 matrix (data = NA, nrow = 1, ncol = 1, byrow =FALSE, dimnames = NULL) 创建一个c(1:12)的三行四列的矩阵， colnames<-c("c1","c2","c3","c4") row 阅读全文

posted @ 2016-03-27 14:23 苑黎阅读(22058) 评论(0) 推荐(0)

R语言中的常用函数

摘要：R语言常用数学函数 (2013-01-04 22:09:00) R语言常用数学函数语言的数学运算和一些简单的函数整理如下：向量可以进行那些常规的算术运算，不同长度的向量可以相加，这种情况下最短的向量将被循环使用。改变编译环境的语言（英语） Sys.setenv(LANGUAGE="en") > 阅读全文

posted @ 2016-03-25 20:44 苑黎阅读(23837) 评论(0) 推荐(2)

R读取数据和导出数据

摘要：对于小数据：用键盘输入数据、 > mydata<-data.frame(age=numeric(0),gender=character(0),weight=numeric(0))> mydata<-edit(mydata) 就会出现一个文本编辑器读入文本文件 scan（file,what=" "( 阅读全文

posted @ 2016-03-19 17:09 苑黎阅读(482) 评论(0) 推荐(0)

R语言中bioconductor包

摘要：安装该包以及扩展包source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("Biostrings") biocLite(" ")library("Biostrings") 阅读全文

posted @ 2016-03-10 14:51 苑黎阅读(567) 评论(0) 推荐(0)

R语言中的数据结构

摘要：R语言的数据结构分为：向量，数组，矩阵，数据框 1,向量： vector(mode = "logical", length = 0) 这里，mode参数表示的是该向量储存数据的类型，length表示该向量的长度。ex：x<-vector(1:10)y<-c("a","b","c","d")2,矩阵：阅读全文

posted @ 2016-03-08 17:37 苑黎阅读(799) 评论(0) 推荐(0)

网页版的R设置环境变量

摘要：此设置可以设置R的环境变量 .libPaths(c( "/GPFS01/softwares/R3.3.3lib",.libPaths())) 可用 .libPaths函数查看R的环境变量阅读全文

posted @ 2016-03-08 11:05 苑黎阅读(289) 评论(0) 推荐(0)

R语言矩阵运算加速

摘要：今天在查关于的运行环境时，就查到了一个加速矩阵运算的一篇日志，感觉很兴奋该日志的网址：http://blog.fens.me/category/r-lang/ 还有一个关于R语言中的环境空间：http://blog.fens.me/r-environments/ 看了还是不太懂，再看点其他资料吧阅读全文

posted @ 2016-01-29 10:15 苑黎阅读(535) 评论(0) 推荐(0)

导航

随笔分类 - R语言