摘要:
病原微生物分析: Eg:痢疾杆菌 测序 比对(K12vs治病菌1vs治病菌2),发现: “毒力岛”:K12没有,两个治病菌有,缩小搜寻范围。 “黑洞”:K12有,但两个治病菌没有。 SARS: 构建系统发育树,发现由冠状病毒进化而来。 不同地区的SARS基因组比较,可溯源病毒传播 根据各SARS冠状 阅读全文
posted @ 2019-11-20 11:32
YUANya
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摘要:
四、基于序列数据的生物进化研究的挑战 解密后由表象进化到分子进化。 构建进化树的步骤: 序列相似性比较 序列同源性比较 构建系统进化树 稳定性检验,因为必须是保守序列。 序列相似性比较。就是将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较,用于确定该序列的生物属性,也就是找出与此序列相似的已知序列是什么。 阅读全文
posted @ 2019-11-20 11:29
YUANya
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摘要:
三、完整基因组的比较研究 研究所有基因的排列,元件之间的相互关系。 人类的HOX gene是果蝇的HOX gene的4倍,说明演化过程中进行2次加倍。 阅读全文
posted @ 2019-11-20 11:28
YUANya
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摘要:
生命组学 生命起源经过复杂演化诞生了大量生物体及其基因组。 现今NCBI最大的基因组: 植物:糖松27.6G 动物:墨西哥蝾螈32.4G 大数据能做什么? 大数据时代如同大航海时代一样,需要具有与时代对应的能力。 用于应对人类挑战:eg:环境暴露组数据 现在的研究模式:知识挖掘 算法模型 数据整合 阅读全文
posted @ 2019-11-20 02:32
YUANya
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