随笔分类 -  scrip

• 【转载】K-mer算法
  摘要：k-mer是指将reads分成包含k个碱基的字符串，一般长短为m的reads可以分成m-k+1个k-mers.举个例子吧，为了简化，有这么个reads（当然实际比这个长）：AACTGACTGA.如果k-mer的k为3的话，我们可以将其切割为AAC ACT CTG TGA GAC ACT CTG TG 阅读全文
  posted @ 2019-06-21 13:27 YUANya 阅读(1688) 评论(0) 推荐(0)
• Needleman_Wunsch
  摘要：Needleman_Wunsch算法思路：1.建立二维数组2.建立评分模式load1：向右；-2load2：向下；-2load3：对角线；依据是否配得到匹配：+1不匹配：-13... 阅读全文
  posted @ 2019-06-20 01:28 YUANya 阅读(149) 评论(0) 推荐(0)