摘要：
研究背景 基因组DNA序列是生命的蓝图，指导着细胞复杂性的发展。虽然蛋白质编码区直接编码生物化学功能，但真核生物基因组的大部分由非编码序列组成。这些非编码区域包含各种调控元件（如启动子、增强子），它们像指挥家一样协调基因的开启和关闭。 一个关键的生物学挑战在于，基因组在细胞核内折叠成多尺度的三维（3 阅读全文
posted @ 2025-12-02 20:15
ylifs
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摘要：
研究背景 随着基因组测序技术的飞速发展，海量的基因组数据以前所未有的速度涌现。然而，要从这些原始的DNA序列中解读出生命的蓝图，精确地识别出基因的位置和结构（即基因注释）是至关重要的一步。传统基因预测方法，如隐马尔可夫模型（HMM），在处理复杂的生物学信号时能力有限，通常需要依赖RNA测序等额外的实 阅读全文
posted @ 2025-12-02 20:02
ylifs
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摘要：
引言 近年来，以GPT-4为代表的基础模型（Foundation Models），或称大语言模型（LLMs），通过在海量文本数据上进行自监督预训练，学会了理解和生成人类语言的强大能力，并彻底改变了自然语言处理领域。这一成功范式迅速启发了其他科学领域的研究者。如果将DNA序列——这段由A, T, C, 阅读全文
posted @ 2025-12-02 19:48
ylifs
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