2025年8月25日
通过Prot_T5模型对蛋白质进行Embedding
摘要： 注意 ESM 进行嵌入之后有开始词和结束词，需要截断。 Prot_T5行嵌入之后有开始词或结束词，我还没搞清楚，总之是和ESM不一样。 在HuggingFace上面下载模型 https://huggingface.co/Rostlab/prot_t5_xl_half_uniref50-enc 一些教 阅读全文
posted @ 2025-08-25 01:14 ylifs 阅读(66) 评论(0) 推荐(0)
通过ESMC模型对蛋白质进行Embedding
摘要： ## 配置区 data=[] #[(id,seq)....] save_path="" # # from esm.models.esmc import ESMC from esm.sdk.api import ESMProtein, LogitsConfig import numpy as np i 阅读全文
posted @ 2025-08-25 00:02 ylifs 阅读(47) 评论(0) 推荐(0)