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2023年9月16日
安装R包相关的一些scripts – 备份
摘要: scripts备忘;省去每次都要翻笔记的时间
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posted @ 2023-09-16 09:09 歪歪ba
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2023年3月26日
(我的)R语言环境准备
摘要: 安装WSL2 参考这里 换源 参考这里 build-essential(gcc,g++,make) 参考这里 安装最新版本的R (4.x.x) 参考这里 安装Rstudio-server 参考这里
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posted @ 2023-03-26 20:54 歪歪ba
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2023年3月14日
检测细胞增殖能力的方法
摘要: 第一类 Ki-67 人体的细胞分裂周期分为G1,S,G2和M期,当M期,即有丝分裂期结束后,一部分细胞就会进入G0期,即静止期, 暂时不再分裂增殖。在正常组织中,绝大部分细胞处于这个状态(静止期)。 Ki67在细胞分裂的G1,S,G2和M期都是表达的,但是M期结束后,Ki67就会很快降解,G0期的细
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posted @ 2023-03-14 16:50 歪歪ba
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一些概念的简介(一)
摘要: 免疫检查点(Immune checkpoint) 是T细胞表面抑制其激活并参与免疫反应的信号通路。免疫检查点如果被激活,就会抑制免疫细胞的作用。 癌细胞为了躲避免疫系统的攻击,一般都会激活免疫检查点,以抑制免疫系统对其攻击。 而如果能阻止癌细胞对免疫检查点的激活,就可以让免疫系统保持正常功能,攻击和
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posted @ 2023-03-14 16:20 歪歪ba
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2023年3月12日
pheatmap实用参数(二)
摘要: # Create test matrix(造数据) set.seed(6) test = matrix(rnorm(200), 20, 10) test[1:10, seq(1, 10, 2)] = test[1:10, seq(1, 10, 2)] + 3 test[11:20, seq(2, 1
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posted @ 2023-03-12 23:54 歪歪ba
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2023年3月8日
命令及options(一)
摘要: ls -r reverse -t 按时间建立先后顺序 cp -r 递归(文件夹) ln -s 原路径 名称 (软连接) tar -zxvf x解压 c创建压缩(看zxcvf在键盘上的位置,方便记忆!) gzip 和 gunzip gzip filename , gunzip filename.gz
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posted @ 2023-03-08 00:12 歪歪ba
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2023年3月5日
PCA图_绘图(一)
摘要: 使用的R包:FactoMineR factoextra FactoMineR提供PCA算法以及(原始)结果;factoextra则extract and visualize the output Principal Component Analysis (PCA), which is used to
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posted @ 2023-03-05 23:03 歪歪ba
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2023年3月4日
ggplot2中文乱码问题
摘要: 之所以出现中文乱码是因为R环境只载入了三种英文字体,没有中文字体可用 解决办法就是从系统字体中载入中文字体,showtext包(会依赖sysfonts包) library(showtext) font_add("SmileySans", regular = "../data/SmileySans-O
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posted @ 2023-03-04 12:36 歪歪ba
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2023年3月2日
pheatmap实用参数(一)
摘要: # Create test matrix test = matrix(rnorm(200), 20, 10) test[1:10, seq(1, 10, 2)] = test[1:10, seq(1, 10, 2)] + 3 test[11:20, seq(2, 10, 2)] = test[11:
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posted @ 2023-03-02 18:41 歪歪ba
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2023年3月1日
sed与awk(一)
摘要: Part1 sed和awk有很多共同点,原因之一是它们起源于相同的行编辑器–ed 对于ed,一些基本的逻辑: 每次处理一行。 交互式。通过一些命令同ed程序本身沟通。例如输入打印命令p来显示当前的行。(没有提示符) 默认情况下,一个命令只影响当前的行。 知道“pointer”处于文件中的哪一行很重要
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posted @ 2023-03-01 22:53 歪歪ba
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