摘要: 结果如下: 阅读全文
posted @ 2019-01-01 21:52 Yellow_huang 阅读(974) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Ref:https://nbviewer.jupyter.org/github/pydata/pydata-book/blob/2nd-edition/ch08.ipynbimport pandas as pddf1 = pd.DataFrame({'key': ['b', 'b', 'a', 'c', 'a', 'a', 'b'], 'data1': r... 阅读全文
posted @ 2019-06-16 12:15 Yellow_huang 阅读(29438) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 起因的需求是 需求是 要找出a文件中id 对应在b文件中的信息,不难,循环a文件中的id,在b文件中进行grep,输出匹配上的上就还可以了 如下图两个文件 写个脚本 ###返回结果纳闷 居然没有匹配上,可我们肉眼都能看出来能匹配的上 上传到服务器还是如此, ###于是使用 -x 参数 调试一下脚本 阅读全文
posted @ 2019-04-27 21:50 Yellow_huang 阅读(6333) 评论(1) 推荐(1) 编辑
摘要: 1.GATK DepthOfCoverage 结果生成四个文件 less test.sample_sumary 结果不是很好 # 2.bamdst: bam文件深度统计 # 软件安装: 测试: cat test.sh 结果文件: 看一下内容: REFERENCE 简书作者:hsy_hzauer 链接 阅读全文
posted @ 2019-01-13 22:11 Yellow_huang 阅读(8442) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: --使用测试: --参数设置介绍: 阅读全文
posted @ 2019-01-10 12:39 Yellow_huang 阅读(5007) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 一.data/newBGIseq500_1.fq和data/newBGIseq500_2.fq中是基于BGIseq500测序平台的一种真核生物基因组DNA的PE101测序数据,插入片段长度为450 bp;已知该基因组大小约在6M左右。 1) 请统计本次测序的PE reads数是多少对reads? 2 阅读全文
posted @ 2019-01-09 19:58 Yellow_huang 阅读(757) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 输出结果如下: 从数据中看几项比较重要的信息: 球员平均年龄为26.4岁,年龄段在19-38岁; 球员平均年薪为730万美金,当时最大的合同为年薪3000万美金; 球员平均出场时间为21.5分钟,某球员场均出场37.8分钟领跑联盟,当然也有只出场2.2分钟的角色球员,机会来之不易。 类似的信息我们还 阅读全文
posted @ 2019-01-08 10:31 Yellow_huang 阅读(3553) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: pycharm中pip install jupyter 安装 Jupyter Notebook 后,启动Jupyter Notebook 报错 解决方法 输入jupyter-notebook 阅读全文
posted @ 2019-01-07 12:55 Yellow_huang 阅读(4215) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 1. 进入setting -> File and Code Templates -> Python Script 2.代码头部分 写入 3.新建脚本就会出现下面的效果 阅读全文
posted @ 2019-01-02 15:23 Yellow_huang 阅读(3117) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 要求文件名以年月 +本次实验编号开始 阅读全文
posted @ 2018-06-17 14:56 Yellow_huang 阅读(209) 评论(0) 推荐(0) 编辑