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2019年11月25日
mol2文件分子名称的批量修改
摘要: 1. 目的及思路 一般软件在读取 \ .mol2 文件时,依据文件内部的标注确定分子名称,而非文件名。在计算分子描述符或其他需要批量读取\ .mol2文件的场合,将不同来源的\ .mol2文件的分子名称进行统一更能方便我们的处理。\ .mol2 文件结构(仅展示包含分子名称的前几行)如下图所示, 为
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posted @ 2019-11-25 12:07 夕阳space
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2019年11月24日
[Python] 一阶马尔科夫链生成随机DNA序列
摘要: 1. 原理 对于DNA序列,一阶马尔科夫链可以理解为当前碱基的类型仅取决于上一位碱基类型。如图1所示,一条序列的开端(由B开始)可能是A、T、G、C四种碱基(且可能性相同,均为0.25),若序列的某一位是A,则下一位碱基是A、T、G、C的概率分别为0.25、0.20、0.20、0.20,下一位无碱基
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posted @ 2019-11-24 22:38 夕阳space
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