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萧飒
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2023年12月29日
显著性添加字母以及ggtree
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posted @ 2023-12-29 15:44 萧飒
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2023年11月29日
GWAS + 选择进化 代码
摘要: library(tidyverse) fst = choose.files() fst1 = read.table(fst, header = T) head(fst1) fst2 = fst1 %>% select(1,2,3,6) %>% top_frac(0.05,wt = MEAN_FST)
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posted @ 2023-11-29 17:54 萧飒
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2023年10月19日
线性回归 Lme4
摘要: data<-readClipboard() data = as_tibble(data) %>% tidyr::separate(value,sep = "\t",into = LETTERS[1:4]) colnames(data) <- as.character(unlist(data[1,])
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posted @ 2023-10-19 14:34 萧飒
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2023年5月24日
维管束单倍型分析及画图
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posted @ 2023-05-24 17:05 萧飒
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2023年2月14日
chatGPT API
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posted @ 2023-02-14 19:12 萧飒
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2023年2月2日
近红外建模5
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posted @ 2023-02-02 23:45 萧飒
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2023年1月15日
二穗短柄草-木聚糖-三种类型
摘要: ###禾本科木聚糖中的一些阿拉伯呋喃糖是间隔均匀的,葡萄糖醛酸的修饰是成簇分布的。 在芒属茎秆木聚糖中,阿拉伯呋喃糖(Araf)的平均取代频率是11%,葡萄糖醛酸(GlcA)的替代是5%左右,但是这种取代是否随机,规则或无规则还不知道。 为了研究这些取代的距离,我们利用两种木聚糖酶(糖基水解酶(GH
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posted @ 2023-01-15 14:46 萧飒
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2022年11月25日
R 类型转换 和问题
摘要: Base R 单个变量 data$x1 <- as.numeric(as.character(data$x1)) 多个变量 i <- c(2, 3) data[ , i] <- apply(data[ , i], 2, # Specify own function within apply func
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posted @ 2022-11-25 15:44 萧飒
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2022年11月18日
PCA要对数据进行预处理的原因
摘要: PCA要对数据进行预处理的原因 1.将数据进行中心化的原因:减去均值等同于坐标移动,这样就能把原始数据点的中心移到与原点重合,此举有利于很多表达,比如数据的协方差矩阵可以直接写成XX',若没有减去均值,则每两个特征之间都要进行(X-X均值)(Y-Y均值)运算,再组合成协方差矩阵。2.将数据除以标准差
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posted @ 2022-11-18 19:12 萧飒
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2022年11月8日
根据文件大小或自定义次数进行复制
摘要: #!/bin/bash cp $1 1mb$1 size=$(stat $1 |grep Size|awk '{print $2}') while [ $size -le $2] do cat $1 >>1mb$1 size=$(stat 1mb$1|grep Size|awk '{print $2
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posted @ 2022-11-08 10:30 萧飒
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