摘要: Jellyfish: 快速统计长序列中每个K-mers出现次数 一个老工具,2011 发表于Bioinformatics,目前引用1018次。因为需要用所以看了一下原文。 Jellyfish,是此研究开发的,可以快速统计长序列中每个K-mers出现次数的软件。 基于K-mers的应用很广,包括基因组 阅读全文
posted @ 2023-04-15 08:57 xiaojikuaipao 阅读(54) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 该软件的使用非常方便,一般使用默认参数就可以出不错的结果。主要分为以下几步: 起始:在之前设置的虚拟环境中创建一个项目文件夹。以后我将把这个项目文件夹称为 SWGA_FOLDER(但您可以而且应该为您的项目命名一个合适的名称!) $ mkdir SWGA_FOLDER $ cd SWGA_FOLDE 阅读全文
posted @ 2023-04-15 06:41 xiaojikuaipao 阅读(165) 评论(0) 推荐(0) 编辑