2017年5月15日

samtools和bcftools使用说明
摘要： 转自：http://www.cnblogs.com/emanlee/p/4316581.html samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。包含有许多命令。以下是常用命令的介绍 1. view view命令的主要功能是：将sam文件转换成bam文件；然后对bam文件进行各种操作，比 阅读全文
posted @ 2017-05-15 18:31 萧飞IDO 阅读(7678) 评论(0) 推荐(0)
变异检测VarScan软件使用说明
摘要： VarScan使用示例，如下： samtools mpileup -q35 -d8000 -f GBS_A909.fa M008_alignmen_F4.sort.bam >M008_alignmen_F4.sort.mpileup samtools mpileup -q35 -d8000 -f G 阅读全文
posted @ 2017-05-15 16:46 萧飞IDO 阅读(3769) 评论(0) 推荐(0)

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