2020年3月20日

摘要: mfrow 基于par布局 注意设置par时,先保存一下原始图像参数。 layout 基于矩阵布局 fig 自定义布局 主要是按照图层比例,自定义放置子图位置 阅读全文
posted @ 2020-03-20 10:10 萧飞IDO 阅读(118) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2020年3月13日

摘要: Argument Verification Using Partial Matching Description match.arg matches arg against a table of candidate values as specified by choices, where NULL 阅读全文
posted @ 2020-03-13 16:25 萧飞IDO 阅读(1882) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 典型关联分析(Canonical Correlation Analysis,以下简称CCA)是最常用的挖掘数据关联关系的算法之一。比如我们拿到两组数据,第一组是人身高和体重的数据,第二组是对应的跑步能力和跳远能力的数据。那么我们能不能说这两组数据是相关的呢?CCA可以帮助我们分析这个问题。 CCA的 阅读全文
posted @ 2020-03-13 15:39 萧飞IDO 阅读(310) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2020年3月9日

摘要: 1.概述 |矩阵|函数| |: :|: :| |表达矩阵|lmFit| |分组矩阵|eBayes| |差异比较矩阵|topTable| 2.读取表达矩阵: 得到表达矩阵exprSet,它的列是各个样本名称,行是各个探针ID,一个纯粹的表达矩阵,必须是数字型的! 可以简单地做一下该表达矩阵的QC检测: 阅读全文
posted @ 2020-03-09 14:45 萧飞IDO 阅读(734) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 本文参考:https://zhuanlan.zhihu.com/p/29399126(详细参考该链接,本文只是记录,以备后续查看) 6. 例子 1 对一台设备进行寿命检验,记录10次无故障工作时间,并按照从小到大的次序排列如下:(单位小时) 420 500 920 1380 1510 1650 17 阅读全文
posted @ 2020-03-09 14:29 萧飞IDO 阅读(5693) 评论(0) 推荐(1) 编辑

2020年1月7日

摘要: VCF是用于描述SNP,INDEL和SV结果的文件,下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件,与SAMtools的结果有点不同 VCF文件可以分为两部分看,最上面 号注释的的部分是对一些参数的解释(看英文能懂的话,下面的解释就不用看了),而下面没 号注释的部分则是各个参数对应的具体的值 一般先关 阅读全文
posted @ 2020-01-07 10:33 萧飞IDO 阅读(830) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年12月20日

摘要: 安装错误 解决办法 阅读全文
posted @ 2019-12-20 17:54 萧飞IDO 阅读(583) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年12月16日

摘要: 一、基础知识 str.format()的使用语法 在主体字符串(string)中,花括号通过 位置 (例如,{1})或 关键字 (例如,{food})指出替换目标及将要插入的参数。 该方法创建并返回一个新的字符串对象,可以被立即打印或保存起来。 例如: 主体字符串也可以是一个临时字符串常量,并且 任 阅读全文
posted @ 2019-12-16 21:04 萧飞IDO 阅读(208) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年12月6日

摘要: AUC原理 一、AUC起源 AUC是一种用来度量分类模型好坏的一个标准。这样的标准其实有很多,例如:大约10年前在 machine learning文献中一统天下的标准:分类精度;在信息检索(IR)领域中常用的recall和precision,等等。其实,度量反应了人们对” 好”的分类结果的追求,同 阅读全文
posted @ 2019-12-06 21:00 萧飞IDO 阅读(1283) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2019年12月2日

摘要: 特征选择是指在众多特征中选择有意义的特征,采用机器学习算法和模型进行训练。 特征选择有三个目的: 可解释性不仅让我们对模型效果的稳定性有更多把握,也能为业务运营等工作提供指引和决策支持。 特征的增多会大大提高模型的搜索空间,大多数模型需要的样本数目随着特征数量的增加而显著增加,特征的增加虽然能更好地 阅读全文
posted @ 2019-12-02 13:50 萧飞IDO 阅读(450) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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