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摘要: 这行代码的作用是将 train_set_y_orig 数组重新调整为一个新的形状,并将其赋值回 train_set_y_orig 变量。 首先,train_set_y_orig.shape[0] 表示获取 train_set_y_orig 数组的第一维大小。接下来,(1, train_set_y_o 阅读全文
posted @ 2023-08-31 16:52 王哲MGG_AI 阅读(39) 评论(0) 推荐(0)
摘要: import numpy as npimport matplotlib.pyplot as plt import sklearn import sklearn.datasetsimport sklearn.linear_model from planar_utils import plot_deci 阅读全文
posted @ 2023-08-31 16:05 王哲MGG_AI 阅读(90) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 这行代码的作用是使用 h5py 库中的 File 函数打开一个 HDF5 文件,并将其赋值给变量 train_dataset。 首先,'datasets/train_catvnoncat.h5' 是 HDF5 文件的路径。接下来,"r" 表示以只读模式打开该文件。最后,h5py.File() 函数打 阅读全文
posted @ 2023-08-31 10:50 王哲MGG_AI 阅读(186) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 这行代码的作用是将 train_dataset 字典中的 "train_set_x" 键对应的值转换为一个 NumPy 数组,并将其赋值给变量 train_set_x_orig。 首先,train_dataset["train_set_x"] 表示从 train_dataset 字典中获取键为 "t 阅读全文
posted @ 2023-08-31 09:15 王哲MGG_AI 阅读(211) 评论(0) 推荐(0)
摘要: import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import h5py import skimage.transform as tf %matplotlib inline ##################################### 阅读全文
posted @ 2023-08-30 11:04 王哲MGG_AI 阅读(82) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Shannon多样性指数是一种常用的衡量生物多样性的指标,它综合了物种丰富度(species richness)和物种均匀度(species evenness)两个方面的信息,反映了一个群落中物种的多样性和相对重要性。​ 其中,S是物种数,pi​是第i个物种的相对丰度,即该物种的个体数占总个体数的比 阅读全文
posted @ 2023-08-23 17:44 王哲MGG_AI 阅读(2744) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 这些数据库在生物学和分子生物学领域中发挥着关键作用,用于注释和分类基因和蛋白质功能,以及理解生物系统的运作方式。 Gene Ontology(GO): 简介: GO是一种用于描述基因和蛋白质功能的标准化分类体系。它将基因和蛋白质的功能划分为分子功能、细胞组分和生物学过程三个大类,每个类别都有多个子类 阅读全文
posted @ 2023-08-23 15:27 王哲MGG_AI 阅读(1473) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 玉米(Zea mays L.)是全球重要的粮食作物之一,具有广泛的农业和经济价值。作为一种重要的作物,玉米的产量和质量受到多种因素的影响,其中包括与根际微生物的相互作用。根际微生物群落是一种复杂的生态系统,由细菌、真菌、古菌等多种微生生物组成,它们栖息在植物根系周围的土壤环境中。这些微生物与植物之间 阅读全文
posted @ 2023-08-23 10:36 王哲MGG_AI 阅读(47) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 在未来的研究中,我们可以采用多组学方法,不仅深入探究微生物群落与玉米基因型、发育阶段和地理位置之间的复杂交互作用网络,还可以开拓一些新领域,为农业的高效、绿色和可持续发展提供更多前沿思路和创新策略。 首先,我们可以推动 "时间序列" 研究,追踪微生物群落与玉米的相互作用在不同发育阶段、季节和气候条件 阅读全文
posted @ 2023-08-22 11:50 王哲MGG_AI 阅读(41) 评论(0) 推荐(0)
摘要: "我们进行了PCoA以可视化不同环境样本中微生物群落的β多样性。PCoA是一种多元统计方法,它将高维的微生物群落数据转化为二维或三维的坐标,以便我们能够更容易地观察样本之间的差异和相似性。通过PCoA,我们能够发现样本在坐标空间中的聚类和分散情况,从而更好地理解不同环境条件下微生物群落的结构变化。" 阅读全文
posted @ 2023-08-22 10:59 王哲MGG_AI 阅读(3511) 评论(0) 推荐(0)
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