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随笔档案-2021年04月

P450酶rosetta对接，设计时的HEM ligated CYM问题

2021-04-23 15:40 by 丨o聽乄雨o丨, 1266 阅读, 收藏,
摘要： P450酶是一类以HEM作为辅酶，并是在催化过程中严重依赖HEM氧化还原循环的一类酶。 在天然环境下，HEM辅酶的Fe原子会与蛋白中一个处于垂直位置的脱氢CYS（CYM）的S形成一个共价键，此共价键基本垂直于HEM平面，其间的距离、角度、二面角都保持在一直相对稳定的状态。 在实际的计算模拟过程中，尤 阅读全文