随笔分类 -  生信分析

摘要：conda简介：一个开源的软件包管理和环境管理系统，可在Windows，macOS和Linux下运行，通过连接服务器可以获取指定的软件包文件以及安装所依赖的各种软件包，有众多的储存库（channels），每个库里包含特定类型的软件以及安装方法，生信主要使用bioconda储存库，储存了众多生物学相关 阅读全文

摘要：WGS数据分析目的：检测出每个样本基因组中的变异集合（不同样本中的差异序列）WGS数据分析流程分为三步：原始数据质控 -> 数据预处理 -> 变异检测1.原始数据质控阶段：拿到原始测序数据 -> QC过滤低质量的read数据2.数据预处理阶段：read比对 -> sort排序 -> 去除重复 -> 阅读全文