数字基因表达谱（Digital Gene Expression Profiling，DGE）

数字基因表达谱（Digital Gene Expression Profiling，DGE）

 

利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术，能够全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况。

 

数字基因表达谱已被广泛应用于基础科学研究、医学研究和药物研发等领域。

 

楼主应该是想说RNA-seq和DGE的区别吧？

 

虽然都是用二代测序的技术来对RNA进行测序，但实验目的和前期样本处理是不同的。

 

通常的RNA-seq，是指对对非rRNA的RNA样本进行二代测序，可以获得transcript的表达量。如果测序量足够的话，还可以研究transcript的结构，研究可变剪切，也可以发现新的transcript。

 

而DGE的话，只是用于获得transcript的表达量。前期处理使用酶切的方法，在每个transcript上切下一段tag序列，然后进行二代测序。这样就可以用这些tag的量来代表tanscript的表达量了。这样的好处在于，相对于RNA-seq，只需要较小的通量，就能获得较稳定的表达量数据。