MINC2.0 在windows上的使用

　　前几天一直纠结如何用VS2005，ITK3.0.0读取mnc格式的图片.由于早期版本的ITK没有mnc格式图片的接口，因此使用了http://www.insight-journal.org/browse/publication/88下载的读取mnc格式图片的程序，之后开始了漫长的安装道路。现在来总结一下。

　　MINC是Medical Imaging NetCDF的缩写，最开始是NetCDF文件格式的一个特例，之后由于MINC1的格式存在大小、存储限制，因此进化成了MINC2，这个格式需要一个新的文件格式库来支持，就是HDF5.具体的内容可以参考MINC 2.0 Programmer's Reference Manual.因此使用MINC2.0首先要安装几个库，hdf5、minc、netCDF、szip和zlib。

　　安装过程是基于VS2005和win7系统的。

　　（1）下载库，我用的版本分别是hdf5-1.8.4，minc2.0，netCDF-3.5.0，szip-2.1，zlib-1.2.3。

　　hdf5-1.8.4：http://www.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.8.4-patch1/obtain5184p1.html

　　minc2.0：http://packages.bic.mni.mcgill.ca/win32/minc-2.0.15_SEP04_08.exe；http://packages.bic.mni.mcgill.ca/win32/minc-2.0.11.exe

　　netCDF-3.5.0：http://www.gfd-dennou.org/arch/ucar/netcdf/contrib/win32/

　　szip-2.1：http://www.hdfgroup.org/ftp/HDF5/prev-releases/hdf5-1.8.4-patch1/bin/win32-vs2005/

　　zlib-1.2.3：http://code.google.com/p/google-desktop-for-linux-mirror/downloads/detail?name=zlib-1.2.3.tar.gz&can=2&q=

　　（2）安装各个库，下载的基本是已经编译好的文件，所以可以直接将.h文件和.lib文件包含到VS2005 options中的C++ directories中即可。

　　（3）新建项目，将最开始下得MINC2的IO文件以及Test文件加入工程中，之后，在项目的properties->Linker->Input->Additional Dependencies中添加所有的库文件：itkgdcm.lib minc2.lib szlibdll.lib volume_io2.lib hdf5dll.lib ITKAlgorithms.lib ITKBasicFilters.lib ITKCommon.lib MSVCRTD.lib LIBCMT.lib ITKDICOMParser.lib ITKEXPAT.lib ITKFEM.lib ITKIO.lib itkjpeg8.lib itkjpeg12.lib itkjpeg16.lib ITKMetaIO.lib ITKniftiio.lib ITKNrrdIO.lib ITKNumerics.lib itkopenjpeg.lib itkpng.lib ITKSpatialObject.lib ITKStatistics.lib itksys.lib itkTestDriver.lib itktestlib.lib itktiff.lib itkv3p_netlib.lib itkvcl.lib itkvnl.lib itkvnl_algo.lib itkvnl_inst.lib itkzlib.lib ITKznz.lib netcdf.lib libszip.lib hdf5.lib hdf5_cpp.lib hdf5_f90cstub.lib hdf5_fortran.lib hdf5_hl.lib hdf5_hl_cpp.lib hdf5_hl_f90cstub.lib hdf5_hl_fortran.lib snmpapi.lib rpcrt4.lib wsock32.lib zdll.lib zlib.lib

　　（4）编译运行即可。运行时可以使用命令行调用，参数只需要输入输入图等，具体的可以参考程序。程序中有一些动态数组定义的问题，可以参考源网站中的评论，有修改的帮助。