摘要： 转录因子是指可以调控基因表达的蛋白。在单细胞分析中，我们可能想知道某个/某群细胞哪些转录因子最活跃，由此来与其它细胞/细胞群作为区分。 这可以使用SCENIC包来完成。其原理可以参考https://zhuanlan.zhihu.com/p/434003188。具体流程可以参考http://www.b 阅读全文

摘要： 在使用R语言绘制好图片后经常需要把图拼在一起，当然使用PPT或者adobe illustrator可以达到这一目的，但相对来说还是会有点麻烦。实际上我们可以使用R语言本身的功能来实现拼图，par和layout函数可以对R语言内置绘图包graphics画出的图进行排列，而patchwork包则是针对g 阅读全文

摘要： 1 加载ChIP-seq信号：首先我们点击File 选择ENCODE ChIP Signals，挑选需要的细胞系和组蛋白修饰方式如H3K27ac，然后点击load即可 2 选择目标区域，以空格分隔：在区域搜索框中输入目标区域(chr9:1-100 chr18:)/基因即可，最后得到的结果如下图: 阅读全文

摘要： 1 Bioinformatics Workbook 这个网站2025还在更新，说明知识是非常前沿的 内容涵盖了Linux入门，HPC相关知识，GNU parallel相关知识，容器相关知识，项目管理相关知识，RNA-Seq相关知识，DNA-Seq等等，非常全面且丰富 2 Griffith Lab 是 阅读全文