2021年3月7日
R语言——根据某一列的重复值，去除该重复值所在的整行
摘要： > x [1] 3 4 5 11 10 9 8 8 9 10 11 12 13 > duplicated(x) #判定重复元素，返回逻辑值 [1] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE > 阅读全文
posted @ 2021-03-07 01:18 我只鹅 阅读(4270) 评论(0) 推荐(0)
2021年3月6日
R语言——limma包进行多组差异表达分析
摘要： 1. 加载表达矩阵 data<-read.table("GSE98793.txt") #log后的表达矩阵（以2为底） 2. 创建样本分类表 获得类似的group列表 group 3. 加载limma包，构建如下矩阵 library(limma) design <- model.matrix(~0+ 阅读全文
posted @ 2021-03-06 23:50 我只鹅 阅读(7688) 评论(0) 推荐(0)
R语言——rep()函数
摘要： # rep(x, …):将vector x的值循环n遍 rep(1:4, 2) [1] 1 2 3 4 1 2 3 4 # times：整个数组循环几遍 rep(1:4, each = 2, times = 3) [1] 1 1 2 2 3 3 4 4 1 1 2 2 3 3 4 4 1 1 2 2 阅读全文
posted @ 2021-03-06 22:40 我只鹅 阅读(1953) 评论(0) 推荐(0)
R语言——dataframe
摘要： R中的表，由行和列组成，与Matrix不同的是，每个列可以是不同的数据类型，而Matrix是必须相同的。 使用data.frame函数构建dataframe student<-data.frame(ID=c(11,12,13), #第一列 Name=c("Devin","Edward","Wenli 阅读全文
posted @ 2021-03-06 22:30 我只鹅 阅读(2833) 评论(0) 推荐(0)
R语言——pheatmap包
摘要： 载入包 library(pheatmap) 载入数据 data_frame = read.csv("file_path.csv", header = T, #将第行设为列名 ) # 将第一列设为行名 rownames(data_frame) = data_frame[,1] data_frame = 阅读全文
posted @ 2021-03-06 21:23 我只鹅 阅读(1135) 评论(0) 推荐(0)
R语言小入门
摘要： R语言的更新 updateR() R包的安装 install.packages("pheatmap") 或 require(pheatmap) #load/install+load 包 Bioconductor的使用 options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc. 阅读全文
posted @ 2021-03-06 20:40 我只鹅 阅读(288) 评论(0) 推荐(0)