OpenCV---分水岭算法
推文：
OpenCV学习(7) 分水岭算法(1)（原理简介简单明了）
OpenCV-Python教程:31.分水岭算法对图像进行分割（步骤讲解不错）
使用分水岭算法进行图像分割
（一）获取灰度图像，二值化图像，进行形态学操作，消除噪点
def watershed_demo(image): blur = cv.pyrMeanShiftFiltering(image,10,100) gray = cv.cvtColor(blur,cv.COLOR_BGR2GRAY) #获取灰度图像 ret,binary = cv.threshold(gray,0,255,cv.THRESH_BINARY|cv.THRESH_OTSU) #将图像转为黑色和白色部分 cv.imshow("binary",binary) #获取二值化图像
#形态学操作，进一步消除图像中噪点 kernel = cv.getStructuringElement(cv.MORPH_RECT,(3,3)) mb = cv.morphologyEx(binary,cv.MORPH_OPEN,kernel,iterations=2) #iterations连续两次开操作，消除图像的噪点
（二）在距离变换前加上一步操作：通过对上面形态学去噪点后的图像，进行膨胀操作，可以得到大部分都是背景的区域（原黑色不是我们需要的部分是背景）
sure_bg = cv.dilate(mb,kernel,iterations=3) #3次膨胀,可以获取到大部分都是背景的区域
（三）使用距离变换distanceTransform获取确定的前景色
根据distanceTransform获取距离背景最小距离的结果（详细看下面相关知识补充）
根据distanceTransform操作的结果，设置一个阈值，使用threshold决定哪些区域是前景，这样得到正确结果的概率很高
dist = cv.distanceTransform(mb,cv.DIST_L2,5) #获取距离数据结果 ret, sure_fg = cv.threshold(dist,dist.max()*0.6,255,cv.THRESH_BINARY) #获取前景色
相关知识补充（重点）
（1）距离变换原理
推文：图像识别中距离变换的原理及作用详解,并附用OpenCV中的distanceTransform实现距离变换的代码!（距离变换的定义讲得不错）
距离变换的处理图像通常都是二值图像，而二值图像其实就是把图像分为两部分，即背景和物体两部分，物体通常又称为前景目标！
通常我们把前景目标的灰度值设为255，即白色
背景的灰度值设为0，即黑色。
所以定义中的非零像素点即为前景目标，零像素点即为背景。
所以图像中前景目标中的像素点距离背景越远，那么距离就越大，如果我们用这个距离值替换像素值，那么新生成的图像中这个点越亮。
再通过设定合理的阈值对距离变换后的图像进行二值化处理，则可得到去除手指的图像(如下图“bidist”窗口图像所示)，手掌重心即为该图像的几何中心。
主要用于计算非零像素到最近零像素点的最短距离。一般用于求解图像的骨骼
def distanceTransform(src, distanceType, maskSize, dst=None, dstType=None): # real signature unknown; restored from __doc__
src：输入的图像，一般为二值图像 distanceType：所用的求解距离的类型，有CV_DIST_L1, CV_DIST_L2 , or CV_DIST_C mask_size：距离变换掩模的大小，可以是 3 或 5. 对 CV_DIST_L1 或 CV_DIST_C 的情况，参数值被强制设定为 3, 因为 3×3 mask 给出 5×5 mask 一样的结果，而且速度还更快。
（3）若是想骨骼显示（对我们的分水岭流程无影响），我们需要对distanceTransform返回的结果进行归一化处理，使用normalize
因为distanceTransform返回的图像数据是浮点数值，要想在浮点数表示的颜色空间中，数值范围必须是0-1.0，所以要将其中的数值进行归一化处理
（重点）在整数表示的颜色空间中，数值范围是0-255，但在浮点数表示的颜色空间中，数值范围是0-1.0，所以要把0-255归一化。
顺便补充：若是不做归一化处理，数值大于1的都会变为1.0处理
mb = cv.morphologyEx(binary,cv.MORPH_OPEN,kernel,iterations=2) #iterations连续两次开操作 cv.imshow("mb", mb) #这是我们形态学开操作过滤噪点后的图像，暂时可以看做源图像 #距离变换 dist = cv.distanceTransform(mb,cv.DIST_L2,5) #这是我们获取的字段距离数值，对应每个像素都有，所以数组结构和图像数组一致 cv.imshow("dist",dist) dist_output = cv.normalize(dist,0,1.0,cv.NORM_MINMAX) #归一化的距离图像数组
cv.imshow("distinct-t",dist_output*50)
发现了似乎distanceTransform返回的图像和源图像一样，似乎出错了
原因：因为distanceTransform返回的是浮点型色彩空间，而dist中存放的数距离0值的最小距离，大多是大于1.0的数值，
而上面提到浮点型色彩空间数值范围0-1.0，当数值大于1.0都会被设置为1.0，显示白色，所以和原来的二值化图像一致，
我们要想显示骨骼，必须先进行归一化处理
下面是从二值化图像源，distanceTransform距离数组，和归一化距离数组中获取的一段像素数组
print(mb[150][120:140]) print(dist[150][120:140]) print(dist_output[150][120:140])
整数型色彩空间二值化图像
[ 0 0 0 0 0 0 0 0 0 255 255 255 255 255 255 255 255 255 255 255]
浮点型色彩空间最小距离数组，由于数值大于1.0都会被设置为1.0，所以和上面二值化图像一致 [ 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 1. 1.4 2.1969 3.1969 4.1969 5.1969 6.1969 7.1969 8.196899 9.196899 10.187599]
浮点型色彩空间归一化数组图像，显示骨骼 [0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0.00047065 0.0006589 0.00103396 0.00150461 0.00197525 0.00244589 0.00291654 0.00338719 0.00385783 0.00432847 0.00479474]
（四）在获取了背景区域和前景区域（其实前景区域是我们的种子，我们将从这里进行灌水，向四周涨水，但是这个需要在markers中表示）后，这两个区域中有未重合部分（注1）怎么办？首先确定这些区域（寻找种子）
注1：
这里是求取硬币偏白色，使用THRESH_BINARY，所以我们获取对象是白色区域，是获取未重合部分
若是我们求取树叶等偏黑，需要使用THRESH_BINARY_INV，此时我们获取的对象是黑色区域，就变为了获取重合部分了
开始获取未知区域unknown（栅栏会创建在这一区域），为下一步获取种子做准备
surface_fg = np.uint8(sure_fg) #保持色彩空间一致才能进行运算，现在是背景空间为整型空间，前景为浮点型空间，所以进行转换 unknown = cv.subtract(sure_bg,surface_fg) cv.imshow("unkown",unknown)
使用print查看背景前景色彩空间不同 print(sure_fg[150][120:140]) print(sure_bg[150][120:140]) --------------------------------------- [0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0.] [ 0 0 0 0 0 0 255 255 255 255 255 255 255 255 255 255 255 255 255 255]
（五）获取了这些区域，我们可以获取种子，这是通过connectedComponents实现,获取masker标签，确定的前景区域会在其中显示为以1开始的数据，这就是我们的种子，会从这里开始漫水
推文：http://m.imooc.com/article/32675
推文：基于矩阵实现的Connected Components算法
利用connectedComponents求图中的连通图
重点：
现在知道了那些是背景那些是硬币（确定的前景区域）了。
那我们就可以创建标签（一个与原图像大小相同，数据类型为 in32 的数组），并标记其中的区域了。
对我们已经确定分类的区域（无论是前景还是背景）使用不同的正整数标记，对我们不确定的区域（unknown区域）使用 0 标记。
我们可以使用函数 cv2.connectedComponents()来做这件事。
它会把对标签进行操作，将背景标记为 0，其他的对象使用从 1 开始的正整数标记（其实这就是我们的种子，水漫时会从这里漫出）。然后将这个标签返回给我们markers 但是，我们知道如果背景标记为 0，那分水岭算法就会把它当成未知区域了。（我们要将未知区域标记为0，所以我们要将背景区域变为其他整数，例如+1）
所以我们想使用不同的整数标记它们。
而对不确定的区域（函数cv2.connectedComponents 输出的结果中使用 unknown 定义未知区域）标记为 0。
#获取mask
ret,markers = cv.connectedComponents(surface_fg)
函数原型：
def connectedComponents(image, labels=None, connectivity=None, ltype=None): # real signature unknown; restored from __doc__
参数：
参数image是需要进行连通域处理的二值图像，其他的这里用不到
返回值：
ret是连通域处理的边缘条数，是上面提到的确定区域（出去背景外的其他确定区域：就是前景），就是种子数，我们会从种子开始向外涨水
markers是我们创建的一个标签（一个与原图像大小相同，数据类型为 in32 的数组），其中包含有我们原图像的确认区域的数据（前景区域）
查看部分markers：（0代表的是背景色，）
[0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 #0是我们的背景区域 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 2 #像这些以1开始的整数就是我们确定的前景区域，就是我们要找的种子 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0]
（六）根据未知区域unknown在markers中设置栅栏，并将背景区域加入种子区域，一起漫水
注意：
watershed漫水算法需要我们将栅栏区域设置为0，所以我们需要将markers中背景区域（原来为0，会干扰算法）设置为其他整数。
解决方法将markers整体加一 #此时种子区域不止我们原来的前景区域，有增加了一个背景区域，我们将从这些区域一起灌水
markers = markers + 1 markers[unknown==255] = 0
（七）根据种子开始漫水，让水漫起来找到最后的漫出点（栅栏边界），越过这个点后各个山谷中水开始合并。注意watershed会将找到的栅栏在markers中设置为-1
markers = cv.watershed(image,markers=markers) #获取栅栏 image[markers==-1] = [0,0,255] #根据栅栏，我们对原图像进行操作，对栅栏区域设置为红色
markers再次查看
[-1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 #漫水算法会将找到的栅栏设置为-1 -1 -1 -1 -1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 -1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 -1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 -1]
（八）结果查看
（九）全部代码
import cv2 as cv import numpy as np def watershed_demo(image): blur = cv.pyrMeanShiftFiltering(image,10,100) gray = cv.cvtColor(blur,cv.COLOR_BGR2GRAY) #获取灰度图像 ret,binary = cv.threshold(gray,0,255,cv.THRESH_BINARY|cv.THRESH_OTSU) #形态学操作，进一步消除图像中噪点 kernel = cv.getStructuringElement(cv.MORPH_RECT,(3,3)) mb = cv.morphologyEx(binary,cv.MORPH_OPEN,kernel,iterations=2) #iterations连续两次开操作 sure_bg = cv.dilate(mb,kernel,iterations=3) #3次膨胀,可以获取到大部分都是背景的区域 cv.imshow("sure_bg",sure_bg) #距离变换 dist = cv.distanceTransform(mb,cv.DIST_L2,5) cv.imshow("dist",dist) dist_output = cv.normalize(dist,0,1.0,cv.NORM_MINMAX) # print(mb[150][120:140]) # print(dist[150][120:140]) # print(dist_output[150][120:140]) cv.imshow("distinct-t",dist_output*50) ret, sure_fg = cv.threshold(dist,dist.max()*0.6,255,cv.THRESH_BINARY) cv.imshow("sure_fg",sure_fg) # print(sure_fg[150][120:140]) # print(sure_bg[150][120:140]) #获取未知区域 surface_fg = np.uint8(sure_fg) #保持色彩空间一致才能进行运算，现在是背景空间为整型空间，前景为浮点型空间，所以进行转换 unknown = cv.subtract(sure_bg,surface_fg) cv.imshow("unkown",unknown) #获取maskers,在markers中含有种子区域 ret,markers = cv.connectedComponents(surface_fg) #print(ret) #分水岭变换 markers = markers + 1 markers[unknown==255] = 0 markers = cv.watershed(image,markers=markers) image[markers==-1] = [0,0,255] cv.imshow("result",image) src = cv.imread("./c.png") #读取图片 cv.namedWindow("input image",cv.WINDOW_AUTOSIZE) #创建GUI窗口,形式为自适应 cv.imshow("input image",src) #通过名字将图像和窗口联系 watershed_demo(src) cv.waitKey(0) #等待用户操作，里面等待参数是毫秒，我们填写0，代表是永远，等待用户操作 cv.destroyAllWindows() #销毁所有窗口
