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摘要： DGL (Deep Graph Learning) 和 PyG (Pytorch Geometric) 是两个主流的图神经网络库，它们在API设计和底层实现上有一定差异，在不同场景下，研究人员会使用不同的依赖库，昇腾NPU对PyG图机器学习库的支持亲和度更高，因此有些时候需要做DGL接口的PyG替换。 阅读全文

摘要： 一 ProteinMPNN介绍 ProteinMPNN（Protein Message Passing Neural Network）是一种基于深度学习的蛋白质序列设计模型，核心目标是解决“逆向折叠问题”（inverse folding problem），即根据给定的蛋白质三维结构，设计出能够折叠成 阅读全文

摘要： 1. 摘要 ESMFold是由Meta AI团队开发的一种基于深度学习的高效蛋白质结构预测模型，其核心目标是利用大规模蛋白质语言模型（ESM）直接从氨基酸序列快速推断蛋白质的三维结构。ESMFold通过预训练的语言模型捕捉序列中的进化与结构关联性，结合几何优化模块生成高精度原子坐标，显著降低了传统方 阅读全文

摘要： 摘要 Geneformer被广泛应用于疾病建模、治疗靶点发掘、基因网络预测与调控分析、基因功能预测与剂量敏感性分析、单细胞转录组数据集成与标准化、遗传变异解释与GWAS靶点优先排序。该案例既有算法原理，也有手把手的昇腾部署教学，包含细胞分类、基因分类、提取细胞嵌入图、细胞多分类的微调任务 1 Gen 阅读全文