2014年10月16日
Run a local BLAST
摘要： In this context, ‘local’ means you are running BLAST on your own server, not at NCBI or anyone else’s server. This gives you the flexibility of compar... 阅读全文
posted @ 2014-10-16 22:59 skylinelzy 阅读(419) 评论(0) 推荐(0)
2014年8月15日
bedtools
摘要： The bedtools utilities are a swiss-army knife of tools for a wide-range of genomics analysis tasks. The most widely-used tools enable genome arithmeti... 阅读全文
posted @ 2014-08-15 15:07 skylinelzy 阅读(405) 评论(0) 推荐(0)
2014年8月12日
linux awk常用操作（快速将fasta格式的序列改成一行显示）
摘要： Some time when you want to change the fasta seq into one lineFor awk: awk '/^>/&&NR>1{print "";}{ printf "%s",/^>/ ? $0" ":$0 }' YourFile > newfilenam... 阅读全文
posted @ 2014-08-12 18:14 skylinelzy 阅读(3838) 评论(0) 推荐(0)
2014年8月11日
Tablet:Next Generation Sequence Assembly Visualization
摘要： Tablet is a lightweight, high-performance graphical viewer for next-generation sequence assemblies and alignmentsDownload Tablet : Information & Compu... 阅读全文
posted @ 2014-08-11 10:27 skylinelzy 阅读(255) 评论(0) 推荐(0)
2014年6月11日
数字PCR简介(一）
摘要： 数字PCR即Digital PCR，它是是一种核酸分子绝对定量技术。数字PCR可让你能够直接数出DNA分子的个数，是对起始样品的绝对定量。 在定量PCR时，我们常常纠结一个问题，究竟是相对定量还是绝对定量呢？现在我们再也不需要去纠结这个问题了，因为数字PCR帮我们解决了。尽管这两种技术有些类似，都... 阅读全文
posted @ 2014-06-11 12:10 skylinelzy 阅读(4316) 评论(0) 推荐(0)