文章分类 - 生物信息小知识
摘要:在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat 2 和 Seurat 3 Seurat 作为单细胞分析中的重量级R包,有多好用用,用过的人都知道。Seurat 分析流程基本涵盖了单细胞分析中的所有常见分析方法,包括filtering,tSNE,UMAP降维及画图等。还有一个重量级功能就是矫正
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摘要:安装R-package XML遇到的问题和解决方式 这个问题已经困扰了我很久很久一直找不到解决之法,后来终于找到了! 安装R-package XML遇到的问题和解决方式 这个问题已经困扰了我很久很久一直找不到解决之法,后来终于找到了! Fedora 27, R 3.5.0, libxml和libxm
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摘要:NAME - 名字 samtools – 序列比对/图谱(SAM)格式的工具箱 SYNOPSIS - 概要 samtools view -bt ref_list.txt -o aln.bam aln.sam.gz samtools sort -T /tmp/aln.sorted -o aln.sor
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摘要:samtools常用命令详解 samtools的说明文档:http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtmlsamtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。包含有许多命令。以下是常用命令的介绍 1. view view命令的主要功能是:将sam文
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