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2017年10月21日
R 包 optparse 之命令行参数传递
摘要: 对于经常与 Linux 打交道的生物信息分析童鞋们,我们今天分享一下怎么在命令行下通过传递参数(类似perl、python) 的方式执行 R 脚本。 一般来说,命令行下使用 Rscript 执行 R 脚本,需要下面几方面信息: 一个输...
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posted @ 2017-10-21 10:46 章鱼猫先生
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2017年10月19日
R 包 pathview 代谢通路可视化
摘要: pathview R 包是一个集成 pathway 通路数据与可视化的工具集。它用于把用户的数据映射并渲染到相关的 pathway 通路图上,用户只需要提供基因或者化合物数据(gene or compound data)并指定目标通路(specify...
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posted @ 2017-10-19 23:10 章鱼猫先生
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