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2018年6月24日
karyoploteR: 基因组数据可视化 R 包
摘要: karyoploteR,是一个适用于所有基因组数据(any data on any genome)非圆环布局(non-circular layouts)的可视化 R/Bioconductor 包。开发该包的团队的目标是致力于打造一款能够像 Circo...
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posted @ 2018-06-24 16:31 章鱼猫先生
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2018年6月18日
2018 俄罗斯世界杯赛程时间表
摘要: 2018 俄罗斯世界杯已经在 6月14日正式拉开了序幕,在这里小编为广大生信人奉上本次世界杯的赛程表(北京时间)。 希望大家在工作学习之余,能够开开心心去享受这场足球盛宴,同时祝福大家端午节快乐! 32 强分组 小...
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posted @ 2018-06-18 11:32 章鱼猫先生
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2018年6月17日
如何向妹纸解释"越位"
摘要: 全球亿万球迷翘首以盼的 2018 世界杯已经打响,在享受这份饕餮盛宴的同时,怎么向妹纸通俗易懂地解释 "越位" ? 比如你和你的男朋友是一队 你的闺蜜是对方球队的守门员 当你传球给你的男朋友时 你的男票比对方任何人都更...
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posted @ 2018-06-17 22:06 章鱼猫先生
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2018年6月16日
R 绘制 GWAS 研究的 Manhattan 图
摘要: 曼哈顿图本质上是一个散点图,用于显示大量非零大范围波动数值,最早应用于全基因组关联分析(GWAS)研究展示高度相关位点。它得名源于样式与曼哈顿天际线相似(如下图)。 近几年,在宏基因组领域,尤其是差异OTU结合分类学结果,采用 Man...
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posted @ 2018-06-16 15:28 章鱼猫先生
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2018年6月14日
Windows全能终端神器MobaXterm
摘要: MobaXterm 又名 MobaXVT,是一款增强型终端、X 服务器和 Unix 命令集(GNU/ Cygwin)工具箱。 MobaXterm 可以开启多个终端视窗,以最新的 X 服务器为基础的 X.Org,可以轻松地来试用 Unix/L...
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posted @ 2018-06-14 23:27 章鱼猫先生
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2018年6月9日
UpSetR 高级参数使用教程
摘要: 在《UpSetR:多数据集绘图可视化处理利器》中我们介绍了 UpSetR 的一些概念和绘图基础参数使用,今天我们来学习一下 UpSetR 的 queries 和 attribute.plots 这两个高级参数的使用。 一 queries...
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posted @ 2018-06-09 22:37 章鱼猫先生
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2018年6月2日
UpSetR:多数据集绘图可视化处理利器
摘要: 说到集合数据可视化,我们第一时间想到的就是韦恩图。在 NGS 相关的研究中,韦恩图用来直观表征不同的集合之间元素重叠关系,是经常在文献中出现的图。 在集合数少的时候韦恩图是很好用的,但是当集合数多比如 5 个以上的时候那就会看的眼花缭乱了。...
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posted @ 2018-06-02 23:39 章鱼猫先生
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2018年5月29日
R画韦恩图之总结
摘要: 本文分享自微信公众号 - 生信科技爱好者(bioitee)。如有侵权,请联系 support@oschina.cn 删除。本文参与“OSC源创计划”,欢迎正在阅读的你也加入,一起分享。
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posted @ 2018-05-29 20:34 章鱼猫先生
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2018年4月6日
基于 python3+nginx 的 Jupyter Notebook 服务端 ssl 访问
摘要: 引言 Jupyter Notebook(原名 ipython)可是科学计算界的必备工具,友好的界面,方便的交互,支持 Markdown,集中的极客们想要的一切特点,同时又制作的如此优雅和精美,真是难能可贵的又好看又好用的工具。 官网 ...
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posted @ 2018-04-06 13:30 章鱼猫先生
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2018年1月12日
使用 conda 和 Jupyter 创建你的自定义 R 包,转换笔记为幻灯片
摘要: 创建你的自定义 R 包 出于用户使用方便考虑,Anaconda 已经在 “R Essentials” 中打包了一些最常用的数据科学 R 包。使用 conda metapackage 命令创建您自己的 R 软件包以便与同行共享也非常容易。例如...
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posted @ 2018-01-12 22:57 章鱼猫先生
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