2018年6月15日

摘要： http://trinotate.github.io/ 装软件： Trinotate TransDecoder sqlite BLAST+ HMMER 阅读全文

摘要： （已装RSEM、bowtie2） $ /util/align_and_estimate_abundance.pl --transcripts trinity.fasta --seqType fq --left 1.fq --right 2.fq --est_method RSEM --aln_met 阅读全文

摘要： 1. RSEM的安装和使用： $ tar -xzf RSEM-1.3.0.tar.gz $ cd RSEM-1.3.0 $ make $ make ebseq $ echo 'PATH=$PATH:/.../' >> ~/.bashrc $ source ~/.bashrc $ extract-tr 阅读全文