摘要：1、ncbi登陆，进入SRA,进入new submission 2、 1）SUBMITTER 2）PROJECT TYPE Raw sequence reads 和 ranscriptome or Gene expression monoisolate(单样本) multiisolate（同一个物种 阅读全文

摘要：1、批量建立文件 1) touch A{1..10} 或 touch linux-`seq 10` 2) for i in {1..10};do echo $i; touch $PWD/; done 3) 2) for i in `seq 10`;do echo $i; touch $PWD/; d 阅读全文

摘要：1、终端的快捷键 终止进程/命令 查找历史命令 2、Gedit文本编辑器 CTRL + S: 保存CTRL + SHIFT + S: 另存为CTRL + S: 搜索CTRL + H: 搜索并替换CTRL + I: 跳到某一行CTRL + C: 复制CTRL + V: 粘贴CTRL + X: 剪切CT 阅读全文

摘要：最近学习了一下基因组的拼接原理，以下是我的学习笔记和一些思考。基因组的拼接原理是高通量测序技术的基础知识吧，我个人认为即使不做基 因组拼接工作，也可以学习一下几个主流拼接软件的算法和原理。我主要是学习了两个网上教程，其教程出处为https://github.com/ TGAC/361Division 阅读全文

摘要：1、注册一个NCBI账户 注册geo账户（老用户和新用户）： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submitter/ 有3个月的时间 GEO DataSets >> GEO Home >> Login to Submit >> Recover Account (老用户 阅读全文

摘要：解决方法分为如下三步： （1） 使用“tr”命令将制表符转换为空格； （2） 使用“tr”命令将多个重复空格删除，保留一个空格； （3） 使用“cut”命令进行域分割，输出正确结果。 1 检测分隔符 cat file | sed -n l #或者cat -A file 上面显示内容中，对于空格仍然按 阅读全文

摘要：概念： 如果两个序列享有一个共同的进化上的祖先,则这两个序列是同源的(homologous) 直系同源:若一一个基因原先存在于某个物种,而而该物种分化为了两个物种,两个物种中的相同的基因功能未变化; 旁系同源的序列因基因复制(gene duplication)而被区分开(separated):若生生 阅读全文