12 2017 档案

38、生物数据库
摘要：核酸数据库：一级：NCBI NIH EMBL ENA DDBJ NIG (共同组成INSDC) ENsemble JCVI(宏基因组，HMP： Human Microbiome Project)等 二级：wormBase FlyBase Unigene等 蛋白数据库： 一级：蛋白序列数据库 Swis 阅读全文
posted @ 2017-12-10 18:09 风中之铃 阅读(1336) 评论(0) 推荐(0)
8、SRR数据下载https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.8.2/
摘要：1、prefetch SRRxxxxxx ～/ncbi/public/sra 2、fastq-dump --split-files xxxxxxsra 3、SRA、SAM以及Fastq文件高速下载方法 3.1 NCBI-SRA和EBI-ENA数据库 SRA数据库: Sequence Read Arc 阅读全文
posted @ 2017-12-04 15:59 风中之铃 阅读(6766) 评论(0) 推荐(0)
7、sraToolkit安装使用
摘要：参考：http://blog.csdn.net/Cs_mary/article/details/78378552 ###prefetch 参数解释 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK158900/#SRA_download.how_do_i_use_the_ 阅读全文
posted @ 2017-12-04 15:57 风中之铃 阅读(8827) 评论(0) 推荐(0)