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2019年8月21日
R语言ggplot中的颜色
摘要: ggplot2分组时默认使用的颜色,可以从另一个hadley写的包,scales包中调用。这个包算是一个工具包,用于和hadley写的其他包配合使用,颜色是其中一部分。 hue_pal函数的默认设置,其中h是色相,范围越大,相邻颜色之间差异越大;c是饱和度,值越大色彩越浓艳饱满;l是亮度,大亮小暗。
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posted @ 2019-08-21 09:59 qinqinyang
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2019年7月4日
Converting mouse to human gene names with biomaRt package
摘要: We can just as easily write a function to go from human to mouse genes.
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posted @ 2019-07-04 17:48 qinqinyang
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2018年12月12日
利用conda创建工作环境
摘要: unset PYTHONPATH echo $PYTHONPATH 代码里面提到的软件,都是根据我们对ATAC-seq搜索学习总结的。 值得一提的是自己为了ATAC-seq建立的软件环境可以很方便移植到另外一台电脑! 首先通过activate target_env要分享的环境target_env,然
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posted @ 2018-12-12 10:34 qinqinyang
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2018年11月7日
R语言分组计数
摘要: 输入数据如下: 分组计数
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posted @ 2018-11-07 14:11 qinqinyang
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2018年11月2日
MAC电脑R语言路径不显示中文
摘要: MAC电脑R语言路径不显示中文,可以设置显示为UTF-8
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posted @ 2018-11-02 14:26 qinqinyang
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2018年8月14日
将一行分成多行.R
摘要: R
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posted @ 2018-08-14 17:39 qinqinyang
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2018年7月18日
temp1
摘要: 1.从bam文件中提取位点的测序深度 samtools depth -b intervals.bed 1.bam intervals.bed文件包括需要提取的位点 chr1 39717581 chr1 39898741 chr1 40928207 chr1 91405097 chr1 9922562
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posted @ 2018-07-18 17:44 qinqinyang
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2018年5月8日
MAC电脑修改ssh端口
摘要: 简单的把过程写一下: 1.备份ssh.plist: cp /System/Library/LaunchDaemons/ssh.plist /Library/LaunchDaemons/ssh2.plist chmod o+w /Library/LaunchDaemons/ssh2.plist vim
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posted @ 2018-05-08 17:34 qinqinyang
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2017年11月27日
根据list调取特定基因的fasta序列
摘要: fasta序列: >ORF type:5prime_partial len:117 (+) 2T_between1k2k_c100001_f2p26_1105:1-351(+)CCCCAGGACATGAAGGGTGCCTCTCGAAGCCCCGAAGACAGCAGTCCGGATGCCGCCCGCAT
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posted @ 2017-11-27 14:47 qinqinyang
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2017年10月13日
Ubuntu apt-get不到最新版软件包解决方案
摘要: 1.可能是系统版本太老的问题解决办法换新系统2.可能是apt源的问题在/etc/apt目录下面有一个source.list文件,修改它,在后面加上下面几个源或者选择性加入 #官方源: 执行 sudo apt-get update 再安装试试 亲测有效。 作者:sarleon链接:https://ww
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posted @ 2017-10-13 09:45 qinqinyang
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