随笔分类 -  R

R-biomaRt使用-代码备份
摘要：目标：使用R脚本从ensembl上下载transcript数据 简单粗暴，直接上代码。biomaRt的介绍晚一点更新。 阅读全文
posted @ 2018-11-12 15:39 陆离可 阅读(283) 评论(0) 推荐(0)
R-描述性统计
摘要：RT。。。老实说这一章我是抖的。。。但是，加油～ 阅读全文
posted @ 2018-11-12 15:35 陆离可 阅读(246) 评论(0) 推荐(0)
R-data.table
摘要：data.table可以扩展和增强data.frame的功能，在分组操作和组合时访问速度更快。 data.table一个重要特性是可以设置指针，设置了之后，可以用指针的值来访问行数据。 可以通过tables()查看当前所有data.table的信息；可以用key(tableName)查看已经设置的指 阅读全文
posted @ 2017-04-26 22:16 陆离可 阅读(140) 评论(0) 推荐(0)
R-ggplot2
该文被密码保护。
posted @ 2017-04-24 15:16 陆离可 阅读(14) 评论(0) 推荐(0)
R-barplot()
摘要：barplot这个函数啊。。。坑。。。度娘的很多解决方案都不对，只好重新看回manual再做测试＝＝ 本文参考的是： https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/graphics/html/par.htmlhttps://stat.ethz.ch/R- 阅读全文
posted @ 2017-04-24 13:29 陆离可 阅读(328) 评论(0) 推荐(0)
R-codes-tips
摘要：1. 在shell执行R文件 chmod 0755 file.R Rscript file.R 2. 载入数据 data(dune) 3. attach() 将data.frame添加到R的搜索路径中，所以可以省略数据框名 summary(mtcars)plot(mtcars$mpg)可以改写为at 阅读全文
posted @ 2017-03-29 16:21 陆离可 阅读(134) 评论(0) 推荐(0)
R语言基础-list matrix array
摘要：列表可以包含多种类型，如数字/字符/向量/data.frame/list 矩阵： 所有元素都是相同的类型。 数组： 与矩阵不同之处在于，矩阵是二维的，数组可以是任意维数。 阅读全文
posted @ 2017-02-28 15:58 陆离可 阅读(831) 评论(0) 推荐(0)
R语言基础-data.frame
摘要：data.frame比较像表格，每一列是一个向量，即每列中的元素是同一类型；所有列具有相同的长度。 **************************************************************************这里不是很懂它们的区别。。。遇到再讲。******* 阅读全文
posted @ 2017-02-28 15:28 陆离可 阅读(511) 评论(0) 推荐(0)
R语言基础
摘要：看vagan的tutorial居然看不懂=。=所以乖乖回来补锅 ×××××××××××××××我是分割线××××××××××××××××××××××××× 参考这篇：http://www.r-tuto 阅读全文
posted @ 2016-11-05 17:45 陆离可 阅读(696) 评论(0) 推荐(0)
安装R语言扩展包diveRsity-1
摘要：今天去了学院的运动会呢～扮熊本熊超开心～写完这篇我补上我的图么么哒 ××××××××××××文末高能预警！！！！！这个包的安装并不是本周的任务！！！！！我真是萌萌哒×××××××××××××× ××××××××××××& 阅读全文
posted @ 2016-11-05 15:35 陆离可 阅读(2816) 评论(0) 推荐(0)
安装R语言扩展包vegan
摘要：这周的作业我开始得好迟啊。。。然而还是要努力做啊。。。 ××××××××××××××我是萌萌哒分割线×××××××××××××××××××××××××××××× 阅读全文
posted @ 2016-11-04 19:49 陆离可 阅读(7924) 评论(0) 推荐(0)
安装生物信息学软件-R
摘要：临时修改R包里的函数 trace(函数名, edit=TRUE) 取消修改： untrace(函数名) 主要参考http://www.3fwork.com/b211/000091MYM021616/ Step 1 : sudo gedit /etc/apt/sources.list 添加到末尾 de 阅读全文
posted @ 2016-10-30 12:45 陆离可 阅读(676) 评论(0) 推荐(0)