摘要：基于稀疏性和位置编码这两个重要概念设计Graph Transformer架构 图的稀疏性 在NLP中，Transformer在词语特征表示时作为全注意力，也就是说，Transformer把一个句子中的词语当作全连接图看待。在NLP中这么设计有两个理由： 很难找到一个句子中单词之间有意义的稀疏联系。因 阅读全文

摘要：本文使用深度神经网络完成计算蛋白质设计去预测20种氨基酸概率。 Introduction 针对特定结构和功能的蛋白质进行工程和设计，不仅加深了对蛋白质序列结构关系的理解，而且在化学、生物学和医学等领域都有广泛的应用。在过去的三十年里，蛋白质设计取得了显著的成功，其中一些设计是由计算方法指导的。最近一 阅读全文