摘要: 在好的状态中应该读一些自我提升的书来应对未来不可预知的状态。所以在当下,提升自我修养是必备,打算读一些相关的书,啥理财书还是以后再读吧。 最近读完了一本道格的《如何成为一个抗压的人》,分享一下读书笔记: 如何成为一个抗压的人 道格·亨施 360个笔记 抗压力,一种让你变得强大的能力 马丁.塞利格曼( 阅读全文
posted @ 2020-08-03 14:27 Bracer 阅读(829) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 最近需要绘制基因调控网络,选择了python语言中比较popular的networkx包,先上目前结果图: 节点是基因或者其他实体,边代表调控关系,黑色的边代表抑制,红色的边代表激活,红色的节点代表自我激活,黑色的节点代表自我抑制。 绘制的关键点:边可以有不同的颜色,指向符号可以修改,可以绘制出自循 阅读全文
posted @ 2020-07-28 09:39 Bracer 阅读(1197) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 最近看了基于布尔网络的基因调控网络(GRN)的一些论文,来总结一下。这三篇论文比较散,不是该方向中的基石,作为了解一些基础布尔网络GRN及其应用即可。 1. An efficient approach towards the source-target control of Boolean netw 阅读全文
posted @ 2020-07-16 11:50 Bracer 阅读(1293) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Quick Update: 之前介绍的方法每次启动jupyter notebook只能在一个虚拟环境里,非常不方便。我们需要一个可以随时切换虚拟环境的list: step 1: 在base环境下将需要的虚拟环境加入list conda install -n env_name ipykernel st 阅读全文
posted @ 2020-05-26 21:25 Bracer 阅读(1328) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 本次来分享一下我对B站宝藏资源(https://b23.tv/BV1ys411472E/p1)“从空间变换的角度理解线性代数” 所做的笔记,该系列video撇开了教科书式的讲解方式,从空间几何的角度出发,用对空间的变换描述方程组。这才是线性代数的本质!推荐越早看越好,学完线性代数若干年后才看到的我遗 阅读全文
posted @ 2020-05-14 11:45 Bracer 阅读(1110) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 本篇blog只是实现去雾与加雾最简单的方法,还有很多高级的,自动的方法,比如CLAHE (对比度有限的自适应直方图均衡)。Q1使用了一个小trick (直方图上累计更新)实现直方图均衡化达到增强图像对比度的目的,Q2先加入一些均匀白噪声,再用高斯滤波器去模糊化,实现提高大像素值的占比,直方图居中化的 阅读全文
posted @ 2020-05-04 09:51 Bracer 阅读(2938) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 最近由于课程原因一直在用MATLAB,发现设计方面真香。虽然界面,自动补全这些软的方面可能不如JetBrains或者微软家族的产品,但是硬的方面真的很棒! ① 代码可以分段执行 这个功能就像jupyter notebook一样,可以分段执行代码(虽然jupyter notebook还可以保存每个代码 阅读全文
posted @ 2020-04-28 22:34 Bracer 阅读(709) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 本次分享一篇今年2月才发表于Nature Methods的基于单细胞转录组数据推断基因调控网络的方法比较的文章,“Benchmarking algorithms for gene regulatory network inference from single-cell transcriptomic 阅读全文
posted @ 2020-04-26 21:12 Bracer 阅读(3457) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 本节我们总结一下数字图像的几何变换,区别于前面几种操作(白平衡,灰度变换,空间滤波)针对于像素强度,几何变换主要针对像素的位置。 对空间的操作主要包括仿射(线性)变换(平移,旋转,伸缩,剪切)和投影变换。每种变换方法的具体细节不展开阐述,就是把对像素(变量)的操作提取出来作为变换矩阵(其实也就是线性 阅读全文
posted @ 2020-03-24 14:50 Bracer 阅读(1536) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 作家龙应台对儿子安德烈说,希望儿子读书用功,将来拥有选择的权力,而不是被迫谋生。广义来讲,如果你不主动,就会由其他的东西让你被动。 就科研来讲,我认为科研的核心要素是好奇心(Curiosity)与立刻动手实践的能力(Hands on directly)。好奇心会驱使你对某一问题进行深入挖掘,就发现的 阅读全文
posted @ 2020-03-23 21:26 Bracer 阅读(233) 评论(0) 推荐(0) 编辑