04 2015 档案

Bioconductor高通量数据基本类的操作和构建
摘要：Bioconductor的两个基础类：ExpressionSet类和SummarizedExpression类ExpressionSet类和SummarizedExpression类是储存高通量数据的两个基础类。ExpressionSet主要用于基于array的研究，它的row是feature，而S... 阅读全文
posted @ 2015-04-18 20:48 Nutastray 阅读(2467) 评论(0) 推荐(0)
HarvardX: PH525.4x Introduction to Bioconductor第二周笔记
摘要：PH525.4x第二周内容围绕GRange类的操作和使用Annotation进行数据关联两个主题展开，并展示了几个比较“炫”的功能。由于内容繁多，信息量大，故笔记之以便日后参考。该课程的演示数据为ChIP-seq的实验数据，背景为人类肝细胞（cell line：HepG2和GM12878）中被ESR... 阅读全文
posted @ 2015-04-11 00:16 Nutastray 阅读(1050) 评论(0) 推荐(0)