nkwy2012

摘要： http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/trackViewer/inst/doc/trackViewer.html Abstract Visualize mapped reads along with annotatio 阅读全文

摘要： yaml语法 格式 它的基本语法规则如下 大小写敏感 使用缩进表示层级关系 缩进时不允许使用Tab键，只允许使用空格。 缩进的空格数目不重要，只要相同层级的元素左侧对齐即可 YAML 支持的数据结构有三种 1、对象：键值对的集合，又称为映射（mapping）/ 哈希（hashes） / 字典（dic 阅读全文

摘要： https://www.cnblogs.com/nxld/p/6059603.html 分析数据要做的第一件事情，就是观察它。对于每个变量，哪些值是最常见的？值域是大是小？是否有异常观测？ ggplot2图形之基本语法： ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离，数据相关的绘图与数据无关的绘图分离 阅读全文

摘要： 在作图过程中，有时我们可能需要通过添加一些线条，使得图形的可视化变得更好，比如一些趋势线等等。 下面我们来看下，一些线条的添加方式。 geom_abline(mapping = NULL, data = NULL, ..., slope, intercept, na.rm = FALSE, show 阅读全文

摘要： https://www.jianshu.com/p/b7274afff14f?from=timeline #先加载包 library(ggpubr) #加载数据集ToothGrowth data("ToothGrowth") head(ToothGrowth) ## len supp dose ## 阅读全文

摘要： 转载：https://www.jianshu.com/p/678213d605a5?from=jiantop.com Hadley Wickham创建的可视化包ggplot2可以流畅地进行优美的可视化，但是如果要通过ggplot2定制一套图形，尤其是适用于杂志期刊等出版物的图形，对于那些没有深入了解 阅读全文

摘要： 转载生信技能树 https://mp.weixin.qq.com/s/JB_329LCWqo5dY6MLawfEA TCGA数据源 - R包RTCGA的简单介绍 - 首先安装及加载包 - 指定任意基因从任意癌症里面获取芯片表达数据 - 绘制指定基因在不同癌症的表达量区别boxplot - 更多box 阅读全文

摘要： 生存分析与R 生存分析是将事件的结果和出现这一结果所经历的时间结合起来分析的一类统计分析方法。不仅考虑事件是否出现，而且还考虑事件出现的时间长短，因此这类方法也被称为事件时间分析（time-to-event analysis）。生存分析是医学领域中一个重要的内容，在肿瘤等疾病的研究中运用十分广泛。 阅读全文

摘要： 什么是置信区间 置信区间又称估计区间，是用来估计参数的取值范围的。常见的52%-64%，或8-12，就是置信区间（估计区间）。 置信区间的概述 1、对于具有特定的发生概率的随机变量，其特定的价值区间：一个确定的数值范围（“一个区间”）。 2、在一定置信水平时，以测量结果为中心，包括总体均值在内的可信 阅读全文

摘要： 生存分析指根据试验或调查得到的数据对生物或人的生存时间进行分析和推断，研究生存时间和结局与众多影响因素间关系及其程度大小的方法，也称生存率分析或存活率分析。常用于肿瘤等疾病的标志物筛选、疗效及预后的考核。 简单地说，比较两组或多组人群随着时间的延续，存活个体的比例变化趋势。活着的个体越少的组危险性越 阅读全文