随笔分类 -  Bioinformatics

把文件内容按照染色体分开写出
摘要：测试序列如下，text.txt: chr2 43995310 43995986 chr17 49788603 49789067 chr17 59565573 59566163 chr19 8390308 8390745 chr12 49188033 49189033 chr7 974903 9755 阅读全文
posted @ 2017-05-22 17:44 Bio-Liu 阅读(571) 评论(0) 推荐(0)
fasta文件中序列的排序
摘要：同样的名为read_1.fa 的fasta文件，里面有若干序列，如： >@r1TGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACNGTACGCTGAGGGCAGAAAAAATCGTCGGGGACATTNTAAAGGCGGCGAGCG 阅读全文
posted @ 2017-05-17 22:03 Bio-Liu 阅读(2944) 评论(0) 推荐(0)
fasta文件中DNA to RNA
摘要：同样的名为read_1.fa 的fasta文件，里面有若干序列，如： >@r1TGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACNGTACGCTGAGGGCAGAAAAAATCGTCGGGGACATTNTAAAGGCGGCGAGCG 阅读全文
posted @ 2017-05-13 22:36 Bio-Liu 阅读(540) 评论(0) 推荐(0)
求fasta文件中序列的反向序列
摘要：同样的名为read_1.fa 的fasta文件，里面有若干序列，如： >@r1TGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACNGTACGCTGAGGGCAGAAAAAATCGTCGGGGACATTNTAAAGGCGGCGAGCG 阅读全文
posted @ 2017-05-13 20:57 Bio-Liu 阅读(917) 评论(0) 推荐(0)
求fasta文件中互补序列
摘要：一个名为read_1.fa 的fasta文件，里面有若干序列，如： >@r1TGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACNGTACGCTGAGGGCAGAAAAAATCGTCGGGGACATTNTAAAGGCGGCGAGCGC 阅读全文
posted @ 2017-05-13 19:26 Bio-Liu 阅读(341) 评论(0) 推荐(0)