天使不设防

摘要： 相关工具： https://github.com/adaptivegenome/repeatseq https://github.com/DecodeGenetics/popSTR https://www.ruhr-uni-bochum.de/spezzoo/cm/cm_phobos.htm htt 阅读全文

摘要： 今天尝试用perl来画一个简单的图，根据数据我们这里画线图。使用的模块是SVG::TT::Graph,两年前更新过，相比perl模块动不动十几年没有新版本，这个模块算不错了，出图格式为SVG格式。 cpan仓库地址： https://metacpan.org/pod/SVG::TT::Graph:: 阅读全文

摘要： perl脚本加密 这里只针对单个文件的perl程序做展示。 pp：https://metacpan.org/pod/pp PAR：https://metacpan.org/pod/PAR 模块安装： cpanm pp cpanm PAR::Filter::Crypto 编译加密： linux: pp 阅读全文

摘要： bamkit 功能很简陋，后续有空再添加些其他功能，当然也可能没有后续了😁 install cargo install bamkit # or git clone https://github.com/sharkLoc/bamkit.git cd bamkit cargo b --release 阅读全文

摘要： 不一次性将数据读入内存，只遍历一次数据即可等概率抽取子集数据，真是神奇。 测试例子： 0到99一百个数字中随机抽取10个数，每个数被抽到概率1/10；重复1000次抽样，结果统计每个数字被抽到的次数为 1000 * 1/10 = 100 次左右。 use rand::Rng; use std::co 阅读全文

摘要： 断断续续的学了些rust语法，就想着写些简单的东西，以熟悉语法为主。这次主要针对fasta文件的简单处理写了fakit，参数也不多可以利用管道组合使用，主要是复杂的功能我不会，哈哈。 github： https://github.com/sharkLoc/fakit install git clon 阅读全文

摘要： bamcov：一个基于命令行的可视化bam文件深度的工具。 软件采用C语言编写，下载附带测试数据，参数较少，使用方便。 github : https://github.com/fbreitwieser/bamcov install : git clone --recurse-submodules h 阅读全文

摘要： 大多数情况下3分钟就能有回应，https://www.ablesci.com/ 阅读全文

摘要： 这里是指数组作为hash的value，即一个key对应多个值 这里利用perl中的特殊句柄DATA做示例用以备忘{perl 数据结构一旦复杂点，可读性急剧下降，坑🕳}。 demo： use strict; use warnings; my %ha; while(<DATA>){ chomp; my 阅读全文

摘要： 一般在实验中样本存在多组值的时候，条形图通常都会加上误差棒，这里的画图脚本留作参考和备忘。 测试数据 sample A B C D E F yzx 587.38 184.66 236.97 5.28 0.44 1.76 yzx 123.52 189.88 145.47 1.53 1.53 0 yzx 阅读全文