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跳过空行： next if /^\s*$/; 变量内插： my $x = 1; my $y = 2; print "$x + $y = @{[ $x + $y ]}" 根据值对数组下标排序： my $max_ele_index = (sort {$data[$b] <=> $data[$a]} 0. 阅读全文
posted @ 2023-02-15 14:20
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工具： B站视频下载工具：https://github.com/leiurayer/downkyi OBS录屏工具：https://obsproject.com/zh-cn window 系统激活工具：https://github.com/massgravel/Microsoft-Activatio 阅读全文
posted @ 2023-02-01 09:13
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B cell ref: https://www.abcam.cn/primary-antibodies/b-cells-basic-immunophenotyping T cell ref: https://www.abcam.cn/primary-antibodies/t-cells-basic- 阅读全文
posted @ 2025-09-18 18:00
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人 小鼠 ref：https://www.abcam.cn/primary-antibodies/immune-cell-markers-poster 阅读全文
posted @ 2025-09-18 17:54
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设立分化簇 (CD) 命名系统的目的是对白细胞表面抗原进行分类。 最初，表面抗原是根据与它们结合的对应单克隆抗体进行命名。随着各实验室逐渐发现抗原常能刺激产生多种单克隆抗体，因此需要采用一种统一的命名系统。1982 年于巴黎举行的第 1 届国际人类白细胞分化抗原专题讨论会 (HLDA) 上通过了目前 阅读全文
posted @ 2025-09-18 17:46
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安装rstudio server后，配置完成，其他组内用户都可登录，唯独我自己账号失败，找了好久原因。 查看日志文件：/var/log/rstudio/rstudio-server/rserver.log 根据关键信息搜索得知，rstudio server默认不允许用户id小于1000的系统账号登录 阅读全文
posted @ 2025-01-15 09:00
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python3 configure参数： ./configure --prefix=/yourpath/python-3.10.12/ \ --enable-loadable-sqlite-extensions \ --enable-optimizations make -j16 make inst 阅读全文
posted @ 2024-12-12 14:07
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紧接前文，各个样本序列组装完毕后，下一步自然是想要弄清楚组装出来的序列中到底是些啥子东西嘛。基因预测方法和工具见这篇推文。 注释工具 常见原核生物基因注释包括 prokka、Prodigal、GeneMark等工具。 这里使用Prodigal对组装的基因组序列进行基因预测： Prodigal软件参数 阅读全文
posted @ 2024-08-12 16:20
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紧接上文, 质控去除宿主（土壤样本不需要去宿主）后下一步对样本序列进行组装。 1、组装工具 宏基因组学中常用序列组装工具不少，如SOAPdenovo2、megagit，spades、metaSPAdes、MOCAT2、IDBA-UD等各有优劣，下面两个软件是分析过程中比较常用的。 spades：ht 阅读全文
posted @ 2024-08-12 15:31
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1、测序数据 数据来源于密歇根大学的一项研究，数据项目号为PRJNA389927。这个研究项目的包括正常、癌前病变和癌症病人样本共181例。项目对应的github地址：https://github.com/SchlossLab/Hannigan_CRCVirome_mBio_2018 ，也可以直接去 阅读全文
posted @ 2024-08-09 13:52
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一个比fastANI更快更准确的工具 paper：Fast and robust metagenomic sequence comparison through sparse chaining with skani | Nature Methods git：bluenote-1577/skani: 阅读全文
posted @ 2024-01-18 10:06
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一、 软件安装： conda search 仓库是有结果的，安装却死活安装不上，直接pip安装成功了，用的清华的源，执行完pip install humann 等了近20min才显示安装完成。 输入humann出现如下信息表示安装成功，接下来安装相应数据库文件。 usage: humann [-h] 阅读全文
posted @ 2024-01-11 16:24
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