生物信息与育种

2024年11月4日

如何定义ggplot2 的scale_fill_manual() 中参数 values 的命名向量？

摘要：需求背景对 R 语言中，ggplot2 的 scale_fill_manual() 函数的 values 参数理解不到位，它这里需要的是一个命名向量，无法在c() 函数内部直接创建一个向量。举例说明，以不同分类数据的条形图来作为图例。比如我有14个不同物种，绘制其不同颜色的条形图，注意颜色不能阅读全文

posted @ 2024-11-04 20:42 生物信息与育种阅读(1118) 评论(0) 推荐(0)

DNA Subway：一个综合性的生物信息学资源平台

摘要： DNA Subway 是一个综合性的生物信息学资源平台，由 CyVerse 开发，旨在提供一个教育性的生物信息学平台，通过将研究级的生物信息学工具、高性能计算和数据库整合到工作流程中，使得用户能够通过一个易于使用的界面进行基因预测、基因注释、基因组分析、系统发育分析和下一代测序数据的分析。地址：h 阅读全文

posted @ 2024-11-04 20:24 生物信息与育种阅读(109) 评论(0) 推荐(0)

2024年10月22日

如何根据标记引物序列找到基因组上具体位置？

摘要：要找到基因组上特定位置，仅凭标记引物序列，可以采用以下几种方法：利用在线工具进行In-Silico PCR：可以使用UCSC Genome Browser提供的In-Silico PCR工具（http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgPcr）进行在线分析。这个工具允许你输阅读全文

posted @ 2024-10-22 09:26 生物信息与育种阅读(1117) 评论(0) 推荐(0)

2024年10月6日

Pangene：李恒开发泛基因图谱构建工具——探索群体基因组时代研究新方向

摘要：导读：七月份，李恒开发的基因内容图谱构建软件——Pangene，以标题为：Exploring gene content with pangene graphs 的论文论文形式一并发表，发表期刊为Bioinformatics杂志。该软件迎合了群体基因组学时代数据井喷的现状，而一定程度上分析工具和软件算阅读全文

posted @ 2024-10-06 22:30 生物信息与育种阅读(705) 评论(0) 推荐(0)

【推荐收藏】国内外常见植物数字化网站

摘要：植物的信息化时代，各种植物的多样性信息，包括名称、图像数据、标本、文献资料等，都在经历数字化，由此诞生了一系列数据库来汇总这些信息，提供线上的查阅，为科研、学术交流、个人兴趣和学习提升提供了极大便利。小编汇总了以下常见植物数字化网站，对植物学感兴趣的朋友们，赶快收藏玩起来吧。国内植物数字化网站植阅读全文

posted @ 2024-10-06 22:29 生物信息与育种阅读(2301) 评论(0) 推荐(0)

关于基因功能及其调控研究的一些套路

摘要：我们团队本身有做基因功能研究出身的，也了解一点分子实验方面的套路。但在这一领域，我们不打算延伸，因为已经有很多公众号做得非常好了，比如说伯远生物。推荐几篇伯远发布的相关文章，希望喂饱你的收藏夹，吃吃灰。基因功能研究的那些套路你知道多少？（上）基因功能研究的那些套路你知道多少？（中）基因功能研阅读全文

posted @ 2024-10-06 22:27 生物信息与育种阅读(132) 评论(0) 推荐(0)

CherryPy ：一个轻量级的 Python Web 框架

摘要： CherryPy 是一个用于构建 Web 应用的微框架。它通过简洁的 API 和强大的功能，使开发者能够快速创建高性能的 Web 应用。在生物信息开发中，数据库搭建和模型部署等场景可能会用到，因此记录下。学习资源官方文档：https://docs.cherrypy.dev/en/latest/ 阅读全文

posted @ 2024-10-06 22:26 生物信息与育种阅读(376) 评论(0) 推荐(0)

智慧农业大数据平台解决方案

摘要：来源：城市大脑解决方案阅读全文

posted @ 2024-10-06 22:24 生物信息与育种阅读(37) 评论(0) 推荐(0)

北大高歌教授综述：生物信息与大语言模型

摘要： 2024年6月，北京大学高歌教授课题组在Quantitative Biology期刊上发表了一篇题为“Foundation models for bioinformatics”的前瞻性综述。文章从基于文本的大语言模型在生物学信息任务上的应用与基于生物学数据预训练的基础模型两个角度探讨了基础模型对生物阅读全文

posted @ 2024-10-06 22:23 生物信息与育种阅读(722) 评论(0) 推荐(0)

田志喜：大豆泛基因组研究进展

摘要： 2024年2月22日，中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜课题组在《遗传》杂志“优博专栏”发表了题为“大豆泛基因组研究进展”综述文章。该综述总结了作物泛基因组的研究脉络，并且以大豆为例介绍了泛基因组研究的一般策略和研究内容，为研究者开展泛基因组工作提供了参考。 DOI: 10.16288/j.yc 阅读全文

posted @ 2024-10-06 22:22 生物信息与育种阅读(261) 评论(0) 推荐(0)

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