植物抗病研究新资源|PlantRG数据库上线,200万+抗性基因一键获取
植物病害每年造成全球粮食作物10%-40%的产量损失。小麦、水稻、玉米、马铃薯、大豆无一幸免。
抗病基因是植物抵御病原入侵的核心武器。但随着测序数据爆发式增长,研究者面临新问题:数据分散、格式不一、分析工具缺失。
今天分享一个刚上线的实用资源:PlantRG。

PlantRG是什么?
这是一个专注植物抗性基因的综合数据库,收录了1062个植物物种的216万多个抗性基因。数据来自794篇已发表论文和107个公共数据库,经过系统整理和质量控制。
核心数据一览
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• 抗性基因总量:2163397个
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• 主要类型覆盖:CNL、TNL、RLP、RLK四大类
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• 功能注释:基于Nr、Pfam、Swiss-Prot、TrEMBL、GO五大数据库
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• 关联资源:20万+ SSR标记、14万+ miRNA、CRISPR引导序列、基因重复类型分析

你能用它做什么?
浏览模块支持按物种分类树快速定位目标植物,点击即可查看该物种所有抗性基因列表。
基因详情页整合了序列信息、结构域组成、功能注释、重复类型、系统发育树,还有相关文献链接。
需要分析工具?数据库内置了5个实用功能:
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• Blast:同源序列搜索
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• HmmerSearch:结构域批量鉴定
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• CasViewer:CRISPR引导序列可视化
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• Circos:基因组共线性展示
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• Primer Design:引物在线设计
所有数据支持批量下载,FASTA格式,直接用于下游分析。

特别适合这些场景?
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• 比较基因组学:跨物种抗性基因家族演化分析
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• 功能基因组学:候选基因筛选与注释
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• 分子育种:SSR标记开发、抗病位点挖掘
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• 非模式植物研究:填补传统数据库的物种覆盖空白

访问方式
网站地址:http://plantrg.bio2db.com
完全开放,无需注册,数据免费使用。
写在最后
植物抗病研究正在从单基因走向全基因组,从模式物种走向多样本。PlantRG的出现,让大规模抗性基因挖掘变得简单。
如果你正在做作物抗病育种、植物免疫机制或比较基因组相关研究,不妨去试试这个新工具。
有使用体验欢迎在评论区交流。



参考文献:He J et al. PlantRG: A Comprehensive and User-Friendly Database for Plant Resistance Gene Analogs. Plant Biotechnology Journal, 2026
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