最小利益

摘要： 第五章 基本统计分析 内容梳理 TLDR记录 描述性统计：离散--频数表、联列表、百分比等，连续--mean、sd等。 变量间相关性分析：离散--独立性检验（卡方，Fisher）、（不独立）相关系数等相关性度量，连续--Pearson积矩相关系数、Spearman相关行书、Kendall’s τ相关 阅读全文

摘要： 这20个题目其实是从用芯片数据做生信分析的初始部分流程拆解而成，里面涉及到的技术内容可能已经过时，比如现在已经用测序数据代替了芯片数据，但生信分析背后的逻辑其实还是类似。 对第10步得到的表达矩阵进行探索，先画第一个样本的所有基因的表达量的boxplot,hist,density ， 然后画所有样本 阅读全文

摘要： 国内学习生信分析，肯定逃不开“生信技能树”的资源，那就翻翻历史资源，从最基本的20个R语言习题开始吧。虽然已经有官方提供的参考答案，网上也已经有很多前辈分享各种坑和知识点，但只有自己亲身实践，才是自己的。 官方题目和官方答案。 准备工作 rm(list=ls(all=TRUE)) setwd("~/ 阅读全文

摘要： 第二章 有限维向量空间 本章学习要点回顾 维数是核心：几乎所有问题都围绕维数展开 基是工具：构造基是证明问题的常用方法 直和是目标：理解直和分解的构造和性质 反例是利器：学会用反例验证猜想 几何是直观：将代数问题几何化有助于理解 核心概念图谱 张成空间，有限维向量空间 线性无关 vs 线性相关 基， 阅读全文

摘要： 第一章 向量空间 核心概念图谱 graph TD; A[第一章：向量空间] --> B[核心定义：向量空间Fⁿ] A --> C[核心对象：子空间] A --> D[核心结构：直和] B --> B1[算术性质：单位元（零），交换性，结合性，分配性，加/乘法逆元] B --> 阅读全文

摘要： 第四章 数据可视化 内容记录 R的基础绘图系统 高水平作图函数直接产生图形如plot()、hist()、boxplot()等 低水平作图函数则在高水平做的图上添加新的图形或元素，如points()、lines()、title()等。 常规绘图： 绘图plot(x轴data, y轴data, type 阅读全文

摘要： 第三章 数据框的操作 内容记录 TLDR记录 数据框结构数据的基本属性（清单列表：head(),tail(),摘要数据：str(),epiDisplay::des()) 操作数据框数据：选取子集subset()，增删元素 dplyr包对数据框数据的操作：筛选，排序，增删变量，统计分析，拆分合并 数据 阅读全文

摘要： 第二章 创建数据集 内容记录 基本数据结构 向量：向量下标从0开始；向量下标可取负值，表示去除指定位置上的元素；R中运算都是向量化的，类似pandas中的运算逻辑；常用的统计函数； 因子：名义型没有顺序关系，有序型分层级和顺序，区别靠定义时区分：定义时是否设定labels的顺序（order=TRUE 阅读全文

摘要： 第一章 R语言介绍 内容记录 R和python很类似，可以通过对比python与R的区别进行学习，尤其对R中独有或有区别的部分，做特殊记录和学习。 有几个功能为R中特别处理： 工作目录管理：通过getwd()获得当前工作目录，通过setwd()设置当前工作目录。设置的目录如果不存在，则使用dir.c 阅读全文

摘要： 需要在两处办公地点不定时、不定点办公，两边都需要处理文档和查找历史文档，从文档同步角度来说，需要的是：一旦插入U盘，自动更新电脑文件与U盘一致。 要实现这个功能，需要使用FreeFileSync和自带的RealTimeSync工具，思路和实现步骤如下： 用 FreeFileSync 正常创建备份任务 阅读全文