初尝XShell破防实录
一直纠结于connection failed没有登录,到头来failed是因为没有登录
输入命令 ssh username@主机ip 登录
目前还没有设置免密登录 已设置免密登录
这次的目的是配置conda环境
了解到miniconda比anaconda更简洁,but好像大多数人都安装的是anaconda,关于XShell安装miniconda的教程以及问题解决就更少了……遂安装失败
打算重振旗鼓安装anaconda
官网下载安装包-->xtfp传输到主机,这一步只要右键点传输就可以了(默认窗口可能很小,看不到下面的传输进程,误以为没反应)
传输速度真的很慢,在等待传输过程中临时起意写个记录()
bash安装时报错 WARNING: md5sum mismatch of tar archive,参考:
Linux 安装 conda WARNING: md5sum mismatch of tar archive-CSDN博客
所以使用压缩包的方式传输文件比较安全
为什么压缩包和原文件大小一样啊((ΩДΩ)
压缩包的用途不是压缩文件大小,而是方便打包加密
qwq类目( Ĭ ^ Ĭ )
今天不打算进行下一步了,十二点断网没搞好的话觉都睡不好o(╥﹏╥)o (*^▽^*)
到这里conda已安装完成,参考文章:
xshell linux系统下安装anaconda(python)_通过xshell下安装python-CSDN博客
纯小白,一开始不知道anocanda和conda还有miniconda都是啥,有啥区别,听了狗屁通的执行命令安装了miniconda,出了各种问题,然而他并不会解决。。因此浪费了好多时间。
忙完这个得好好看看博客美化了(⊙︿⊙)俺也想要一个美观滴博客
安装esmfold
这是Facebook开发的一个蛋白质语言模型,要通过这个工具来验证师兄的学术课题
读readme->读不懂->放弃
esmfold要用到nvcc编译器,所以要先安装cuda toolkit
节点已安装cuda,直接安装pytorch
cuda版本是11.2的在官网没有对应的pytorch版本信息,好在已经有大佬验证过成功方案,于是踩着前人的脚印!
python pytorch-GPU 环境搭建 (CUDA 11.2)_cuda11.2对应的pytorch-CSDN博客
使用此方法要注意虚拟环境的python版本是3.8,然后执行如下命令安装1.9.1版本的pytorch
pip install torch==1.9.1+cu111 torchvision==0.10.1+cu111 torchaudio==0.9.1 -f https://download.pytorch.org/whl/torch_stable.html --trusted-host pypi.org --trusted-host download.pytorch.org --trusted-host files.pythonhosted.org
xshell的使用以及远程配置服务器的anaconda环境的说明_xshell安装anaconda-CSDN博客(配置3.8python conda)
我真服了,读研我是狗
今天,昨天组会大概九点多就结束了,然后师兄给大家讲了讲用模型跑数据的代码怎么写,救命,当时听得迷迷糊糊的还没做笔记,现在只记得要先解析蛋白质序列了。得到包含长度在内的三个基础关键信息,然后给长度排序?还有通过梯度向量什么的处理数据,然后把数据导入模型,save结果。
ε=(´ο`*)))唉没关系,师兄说三月底会给大家培训()然后就是不停地唠嗑……张大师寒假开班七天居然赚了三万块(ΩДΩ),这还上什么学()
有些问题师兄直接给出了明确的解决方案,比自己Google方便多了(*╹▽╹*)感谢师兄Thanks♪(・ω・)ノ
第一次觉得实验室好像也没有那么可怕。周二周三晚上都在装esmfold,周末有空可能会写个过程。(等我把openfold装好以后)
周三晚上因为断网还借了一个研究生师兄的校园网
晚上十点多回宿舍路上和同学边走边聊天(虽然还是会感觉有点尬啦)真的会有一种自己是真真切切活着的感觉啊拜托!又开始胡言乱语了
还有这博客到底怎么美化, (⊙o⊙)…
乐,旁边在玩4399