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随笔分类 -  linux

ubuntu更换阿里源
摘要：网上应该可以找到很多关于ubuntu源的设置方法，但是如果不搞清楚就随便设置的话，不仅不能起到应有的效果，还会由于一些问题导致apt不可用。最正确的更换源的方法应该如系统提示的：## a.) add 'apt_preserve_sources_list: true' to /etc/cloud/cl... 阅读全文
posted @ 2015-08-09 16:40 Lyon2014 阅读(49029) 评论(0) 推荐(4)
记一次开源软件的篡改
摘要：pandaseq是一款非常好用的序列拼接软件，项目传送：https://github.com/neufeld/pandaseq/ （编译安装前需要libtool-devel）所谓科技服务和科研态度有的时候真的不统一，在pandaseq拼接的时候，如果输出fastq文件，overlap部分，如果错配的... 阅读全文
posted @ 2015-08-06 16:54 Lyon2014 阅读(662) 评论(1) 推荐(0)
linux下搜索指定内容
摘要：echo " ls *.$2 | while read file;do out=$( (grep -n $1 $file) ) [ -n \"$out\" ] && echo $file,$out;done">search.sh搜索：sh search.sh get_longest_overlap ... 阅读全文
posted @ 2015-08-06 11:50 Lyon2014 阅读(196) 评论(0) 推荐(0)
shell的含义
摘要：shell：壳，是操作linux最直接的方式，通过shell中输入命令和linux系统进行交互。shell是一个小盒子，每一个有独立的命名空间，登录后的操作就是一个shell（有可能是bash，zsh等），每一个shell脚本都是一个shell；每个shell中的变量名称不会互相影响；~/.bash... 阅读全文
posted @ 2015-08-04 11:03 Lyon2014 阅读(374) 评论(0) 推荐(0)
使用plenv安装perl，并使其支持多线程
摘要：plenv与pyenv、rbenv等都是同类型软件中非常好用的，这三个软件不仅命名类似，操作方式也相差无几，节约了很多学习的成本，所以非常推荐；安装使用plenv：1 git clone git://github.com/tokuhirom/plenv.git ~/.plenv2 git clone... 阅读全文
posted @ 2015-07-22 20:12 Lyon2014 阅读(845) 评论(0) 推荐(0)
git环境搭建以及第一个PHP程序
摘要：使用mac下的sublime等编辑器帮助代码编写，然后到linux下运行网页代码。可以通过/vagrant共享目录完成，但是默认apache默认目录为/var/www/html，不想改变该目录，同时为了方便“云管理”，使用git和github统一管理代码。1. 在github建立新仓库：learn_... 阅读全文
posted @ 2015-06-30 22:41 Lyon2014 阅读(475) 评论(0) 推荐(0)
Ubuntu下LAMP环境配置
摘要：接下来是搭建个人学习环境，之前的随笔介绍了个人的网络配置，简单记录一下。1. 安装apache： apt-get install apache22. 安装php5：apt-get install php5 php相关模块：apt-get install php5-clilibapache2-mod-php5 php5-mysqlphp5-gd php5-imap php5-fpm ph... 阅读全文
posted @ 2015-06-30 21:14 Lyon2014 阅读(166) 评论(0) 推荐(0)
CentOS下LAMP环境安装配置
摘要：本来几下yum都能装好的，yum却出问题了，报错：AttributeError: 'YumBaseCli' object has no attribute '_not_found_i'，可能是某个文件缩进出了问题，搞了半天没弄明白，干脆重装yum：首先确保你有root权限，下面命令有些指定sudo，... 阅读全文
posted @ 2015-06-30 13:50 Lyon2014 阅读(897) 评论(0) 推荐(0)
linux保持管道中颜色显示
摘要：在linux工作中，不同类型的文件以不同的颜色显示，如文件夹显示蓝色，压缩文件显示橘黄色，可执行文件显示为绿色，链接失效文件高亮显示等等；有时候根据颜色可以快速鉴别，如我有时为了保持目录的完整性，会讲一些存放在其他盘阵下面的文件通过软链接的方式链接过来，如果全部成功链接，同时能够说明没有文件丢失。但是当一个目录中文件特别多，多到好几个屏幕都显示不了时，往往需要通过管道来查看：ls -l | les... 阅读全文
posted @ 2015-03-19 22:38 Lyon2014 阅读(1984) 评论(0) 推荐(1)
Ascall 码特殊字符——去除从windows上传文件的^M
摘要：在windows上编辑过的文件如果传到unix上，在每个文件的末尾都会有一个换行控制符^M，这个字符一般处于隐藏状态，除非cat -A才能看到，如果不去掉这个符号，很多脚本不能正常运行，很多文件不能正常被正则表达式匹配，去除类似的控制字符是让这些文件恢复正常使用的必须步骤；根据上面的ascall字符代码表，左边两列非打印控制字符显示了每个字符的ascall码，接下来的工作就是用正则表达式匹配出这些... 阅读全文
posted @ 2015-03-19 22:20 Lyon2014 阅读(952) 评论(0) 推荐(0)
boost安装
摘要：1 boost介绍Boost库是一个可移植、提供源代码的C++库，作为标准库的后备，是C++标准化进程的开发引擎之一。Boost库由C++标准委员会库工作组成员发起，其中有些内容有望成为下一代C++标准库内容。在C++社区中影响甚大，是不折不扣的“准”标准库。Boost由于其对跨平台的强调，对标准C... 阅读全文
posted @ 2014-10-31 12:23 Lyon2014 阅读(268) 评论(0) 推荐(0)
linux系统中，文件的三种特殊权限
摘要：背景介绍在linux系统中，我们熟知有rwx三种权限，对应所有者，同组用户，其他用户三种用户的权限，一共9个位来指定一个文件的权限情况，通过chmod xxx 来更改权限属性，其中xxx是已八进制表示的三个数，正好对应9个权限位，比如，777代表所有用户可读写执行，755表示所有用户可读执行，但是只... 阅读全文
posted @ 2014-09-29 16:48 Lyon2014 阅读(1776) 评论(0) 推荐(0)