随笔分类 - Python
摘要：scipy在numpy的基础上提供了众多的数学、科学以及工程计算中常用的模块；是强大的数值计算库；1. 常数和特殊函数scipy的constants模块包含了众多的物理常数：import scipy.constants as CC.c #真空中的光速C.h #普朗克常数C.pi #圆周率在C.physical_constants字典中，通过物理常数的名称访问该物理常数，如：C.physica...
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摘要：1. 线性代数numpy对于多维数组的运算在默认情况下并不使用矩阵运算，进行矩阵运算可以通过matrix对象或者矩阵函数来进行；matrix对象由matrix类创建，其四则运算都默认采用矩阵运算，和matlab十>分相似：a = np.matrix([[1,2,3],[4,5,6],[7,8,9]])matrix([[1, 2, 3],[4, 5, 6],[7, 8, 9]])a * amatri...
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摘要：1.常规函数与排序常用统计函数：求和：sum()、均值：mean()、标准差：std()、方差：var()、最小值：min()、最大值：max()、最大值与最小值之差：ptp()、最大值的下标：argmax()、最小值的下标：argmin()、中值：median()上述函数都可以指定axis，来沿着某一轴操作；除了mean()函数求均值，还可以使用average()，并且可以指定weights参数...
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摘要：多维数组下标多维数组的下标是用元组来实现每一个维度的，如果元组的长度比维度大则会出错，如果小，则默认元组后面补 : 表示全部访问；如果一个下标不是元组，则先转换为元组，在转换过程中，列表和数组的转换有所不同。一个列表会被转换成各个元素组成的元组，然后进行访问（此时如果不全为整数的话，则不会共享存储区域，因为无法通过改变步长来保持存储结构不变）；如：lidx=[[0],[1],[2]]；如果用lid...
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摘要：Mayavi是python的一个包，提供方便的可视化方案。目前（20150809）Mayavi还没有py3的支持，以下安装环境在python 2.7.10下进行安装Mayavi：1. 通过pip install mayavi自动检测并且安装大部分的依赖包： apptools、traits、trai...
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摘要：ufunc简介ufunc指universal function，是一种能够对数组中的所有元素进行操作的函数，ufunc是针对数组进行操作的函数，对一个数组进行重复的运算时，使用ufunc比math库中的函数效率要高很多，然而由于ufunc会对数组做一些特殊操作，所以在单一值的函数处理上就比math库中的效率要低；在使用ufunc时，注意千万不要用循环遍历，而是应该使用列表推导式，否则就不叫ufun...
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摘要：ndarray：n-dimensional array object，即多维数组对象，是python自带的array对象的扩展，array对象和list对象的区别是array对象的每一个元素都是数值，而list保存的是每个元素对象的指针，而作为array对象的扩展，ndarray在科学计算中就非常适合并且功能强大。创建ndarray1. 使用列表对象创建ndarrayimport bumpy as...
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摘要：rpy2是python中的R语言接口模块，今天捣鼓了一个下午，终于把rpy2搞定，记录一下安装过程中需要注意的问题：1. R编译的过程中，必须选择--enable-R-shlib 选项，将R编译成lib模式，在此模式下，会生成path-to-R/lib/libR.so库； 同时，确保同目录下lib...
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摘要：16S数据质控流程，一次下机lane包括很多的项目，每个项目有独立的合同号，一个项目可能包含16S或者ITS两种，通过一个完整的pipeline，将上游拆分好的数据全部整理成可以直接分析的数据。原本这个工作是通过并行的sge实现，是运行层面的并行，现在在程序层面实现并行处理，可以脱离sge系统工作。...
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摘要：python中实现并发的方式有很多种，通过多进程并发可以真正利用多核资源，而多线程并发则实现了进程内资源的共享，然而Python中由于GIL的存在，多线程是没有办法真正实现多核资源的。对于计算密集型程序，应该使用多进程并发充分利用多核资源，而在IO密集型程序中，多核优势并不明显，甚至由于大多数时间都...
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摘要：django.contribdjango.contrib是django中附带的一个工具集，由很多的附加组件组成。这些附加组件包括管理工具（django.contrib.admin）、用户鉴别系统（django.contrib.auth）、PostgreSQl详细信息提取（django.contrib.postgres）、匿名会话（django.contrib.sessions）等等。详细的列表可以...
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摘要：URLconfDjango通过URLconf来响应网页请求，在项目设置settings.py中，设定了ROOT_URLCONF值来指定默认的URLconf（即mysite.urls），当HTTPRequst中没有urlconf属性的话，便会访问该默认值。在urlconf中，设定了一组pattern：...
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摘要：Variables在模板中，使用两个大括号包含变量的方式来使用变量：{{ name }}该变量应该作为键值对中的键，在Context中能被查找到。Tags模板中使用Tags来进行简单的逻辑：{% commet %} #body{% endcommet %}Django内置了大量的Tags：1. i...
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摘要：通过Django中的模板，使得设计人员和网站管理有一个对接的接口，实现网页设计和逻辑的分离，因此，模板会处理大量的文本解析内容，django中内部使用了高效的引擎来完成模板解析。模板设置在使用模板前，需要对django进行配置，在项目目录的setting.py中，TEMPLATES = [ { ...
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摘要：进程与线程在多任务处理中，每一个任务都有自己的进程，一个任务会有很多子任务，这些在进程中开启线程来执行这些子任务。一般来说，可以将独立调度、分配的基本单元作为线程运行，而进程是资源拥有的基本单位。python支持多进程multiprocessing，以及多线程threading。多进程os.fork()函数可以开启一个进程。该函数会返回两次值，分别在父进程中返回子进程的ID，而在子进程中永远返回0...
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摘要：创建模型模型对应工程中的应用，一个工程可能包含很多的应用，通过命令python manage.py startapp myapp创建一个叫myapp的应用，django会帮助生成以下目录：polls/ __init__.py admin.py migrations/ __init__.p...
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摘要：使用ftplib，轻松实现从ftp服务器上下载所需要的文件，包括目录结构等，支持了一下断点续传 1 from ftplib import FTP 2 import sys 3 import os 4 import re 5 6 def ftpconnet(ftpserver,port,userna...
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摘要：创建一个工程：django-admin.py startproject mySite将会产生以下文件：mySite/ manage.py mySite/ __init__.py settings.py urls.py wsgi.py配置工程编辑settings.py文件，...
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摘要：1. 使用Vagrant 创建ubuntu虚拟机：首先安装vagrant，网上有比较多的方法，如：http://www.th7.cn/system/mac/201405/55421.shtml我使用了ruby的包管理工具gem安装：gem install vagrant之后mkdir myUbunt...
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摘要：django document 提供了非常详尽的资料：https://docs.djangoproject.com/en/1.8/。 按照django document推荐，搭建开发环境：使用vagrant搭建了ubuntu 14.1系统，python和django版本分别是3.4.3和1.8.2，使用pyenv，三步法快速配置：git clone https://github.com/yyuu/...
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