sratoolkit 的使用

一.主要功能有两个:

1.下载分析所需的测序数据SRR

2.将sra后缀的文件格式转换为fastq文件

 

二:具体用法如下

1.下载数据:

prefetch SRR3589950 

2.文件格式转化:

fastq-dump  --gzip  --split-3 -O  /home/lmt/biosoft  -A SRR3589950.sra

 

posted @ 2017-08-28 10:07  遗世独立的愚公  阅读(742)  评论(0编辑  收藏  举报